Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4Q8

Colec12, Collectin-12, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colec12Q8K4Q8 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Colec12Q8K4Q8 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Colec12Q8K4Q8 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Colec12Q8K4Q8 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Colec12Q8K4Q8 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Colec12Q8K4Q8 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Colec12Q8K4Q8 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Colec12Q8K4Q8 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Colec12Q8K4Q8 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Colec12Q8K4Q8 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Colec12Q8K4Q8 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Colec12Q8K4Q8 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Colec12Q8K4Q8 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Colec12Q8K4Q8 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Colec12Q8K4Q8 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Colec12Q8K4Q8 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Colec12Q8K4Q8 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Colec12Q8K4Q8 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Colec12Q8K4Q8 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Colec12Q8K4Q8 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Colec12Q8K4Q8 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Colec12Q8K4Q8 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Colec12Q8K4Q8 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Colec12Q8K4Q8 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Colec12Q8K4Q8 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Colec12Q8K4Q8 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Colec12Q8K4Q8 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Colec12Q8K4Q8 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Colec12Q8K4Q8 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Colec12Q8K4Q8 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Colec12Q8K4Q8 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Colec12Q8K4Q8 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Colec12Q8K4Q8 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Colec12Q8K4Q8 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Colec12Q8K4Q8 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Colec12Q8K4Q8 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Colec12Q8K4Q8 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Colec12Q8K4Q8 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Colec12Q8K4Q8 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Colec12Q8K4Q8 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Colec12Q8K4Q8 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Colec12Q8K4Q8 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Colec12Q8K4Q8 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Colec12Q8K4Q8 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Colec12Q8K4Q8 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Colec12Q8K4Q8 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Colec12Q8K4Q8 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Colec12Q8K4Q8 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Colec12Q8K4Q8 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Colec12Q8K4Q8 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Colec12Q8K4Q8 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Colec12Q8K4Q8 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Colec12Q8K4Q8 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Colec12Q8K4Q8 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Colec12Q8K4Q8 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Colec12Q8K4Q8 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Colec12Q8K4Q8 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Colec12Q8K4Q8 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Colec12Q8K4Q8 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Colec12Q8K4Q8 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Colec12Q8K4Q8 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Colec12Q8K4Q8 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Colec12Q8K4Q8 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Colec12Q8K4Q8 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Colec12Q8K4Q8 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Colec12Q8K4Q8 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Colec12Q8K4Q8 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Colec12Q8K4Q8 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Colec12Q8K4Q8 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Colec12Q8K4Q8 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Colec12Q8K4Q8 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Colec12Q8K4Q8 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Colec12Q8K4Q8 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Colec12Q8K4Q8 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Colec12Q8K4Q8 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Colec12Q8K4Q8 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Colec12Q8K4Q8 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Colec12Q8K4Q8 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Colec12Q8K4Q8 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Colec12Q8K4Q8 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Colec12Q8K4Q8 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Colec12Q8K4Q8 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Colec12Q8K4Q8 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Colec12Q8K4Q8 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Colec12Q8K4Q8 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Colec12Q8K4Q8 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Colec12Q8K4Q8 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Colec12Q8K4Q8 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Colec12Q8K4Q8 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Colec12Q8K4Q8 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Colec12Q8K4Q8 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Colec12Q8K4Q8 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Colec12Q8K4Q8 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Colec12Q8K4Q8 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Colec12Q8K4Q8 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Colec12Q8K4Q8 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Colec12Q8K4Q8 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Colec12Q8K4Q8 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Colec12Q8K4Q8 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Colec12Q8K4Q8 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms