Protein–RNA interactions for Protein: Q8K389

Cdk5rap2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5rap2Q8K389 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdk5rap2Q8K389 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdk5rap2Q8K389 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdk5rap2Q8K389 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdk5rap2Q8K389 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdk5rap2Q8K389 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdk5rap2Q8K389 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdk5rap2Q8K389 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdk5rap2Q8K389 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdk5rap2Q8K389 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdk5rap2Q8K389 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdk5rap2Q8K389 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdk5rap2Q8K389 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdk5rap2Q8K389 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdk5rap2Q8K389 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdk5rap2Q8K389 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdk5rap2Q8K389 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdk5rap2Q8K389 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdk5rap2Q8K389 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdk5rap2Q8K389 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdk5rap2Q8K389 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdk5rap2Q8K389 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdk5rap2Q8K389 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdk5rap2Q8K389 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdk5rap2Q8K389 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdk5rap2Q8K389 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdk5rap2Q8K389 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdk5rap2Q8K389 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdk5rap2Q8K389 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdk5rap2Q8K389 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cdk5rap2Q8K389 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cdk5rap2Q8K389 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cdk5rap2Q8K389 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cdk5rap2Q8K389 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cdk5rap2Q8K389 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cdk5rap2Q8K389 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cdk5rap2Q8K389 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cdk5rap2Q8K389 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cdk5rap2Q8K389 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cdk5rap2Q8K389 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdk5rap2Q8K389 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdk5rap2Q8K389 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdk5rap2Q8K389 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdk5rap2Q8K389 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdk5rap2Q8K389 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdk5rap2Q8K389 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdk5rap2Q8K389 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdk5rap2Q8K389 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdk5rap2Q8K389 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdk5rap2Q8K389 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdk5rap2Q8K389 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdk5rap2Q8K389 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdk5rap2Q8K389 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdk5rap2Q8K389 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdk5rap2Q8K389 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdk5rap2Q8K389 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdk5rap2Q8K389 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdk5rap2Q8K389 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdk5rap2Q8K389 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdk5rap2Q8K389 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdk5rap2Q8K389 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdk5rap2Q8K389 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdk5rap2Q8K389 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdk5rap2Q8K389 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdk5rap2Q8K389 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdk5rap2Q8K389 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdk5rap2Q8K389 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdk5rap2Q8K389 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdk5rap2Q8K389 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdk5rap2Q8K389 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdk5rap2Q8K389 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdk5rap2Q8K389 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdk5rap2Q8K389 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdk5rap2Q8K389 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdk5rap2Q8K389 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdk5rap2Q8K389 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdk5rap2Q8K389 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdk5rap2Q8K389 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdk5rap2Q8K389 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdk5rap2Q8K389 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdk5rap2Q8K389 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdk5rap2Q8K389 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdk5rap2Q8K389 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdk5rap2Q8K389 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdk5rap2Q8K389 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdk5rap2Q8K389 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdk5rap2Q8K389 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdk5rap2Q8K389 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdk5rap2Q8K389 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdk5rap2Q8K389 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdk5rap2Q8K389 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdk5rap2Q8K389 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdk5rap2Q8K389 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdk5rap2Q8K389 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdk5rap2Q8K389 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdk5rap2Q8K389 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdk5rap2Q8K389 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdk5rap2Q8K389 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdk5rap2Q8K389 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdk5rap2Q8K389 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms