Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Y9

Ccm2, Cerebral cavernous malformations protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccm2Q8K2Y9 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccm2Q8K2Y9 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccm2Q8K2Y9 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccm2Q8K2Y9 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccm2Q8K2Y9 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccm2Q8K2Y9 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccm2Q8K2Y9 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccm2Q8K2Y9 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccm2Q8K2Y9 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccm2Q8K2Y9 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccm2Q8K2Y9 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccm2Q8K2Y9 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccm2Q8K2Y9 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccm2Q8K2Y9 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccm2Q8K2Y9 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccm2Q8K2Y9 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccm2Q8K2Y9 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccm2Q8K2Y9 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccm2Q8K2Y9 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccm2Q8K2Y9 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccm2Q8K2Y9 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccm2Q8K2Y9 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccm2Q8K2Y9 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccm2Q8K2Y9 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccm2Q8K2Y9 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccm2Q8K2Y9 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccm2Q8K2Y9 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccm2Q8K2Y9 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccm2Q8K2Y9 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccm2Q8K2Y9 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccm2Q8K2Y9 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccm2Q8K2Y9 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccm2Q8K2Y9 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccm2Q8K2Y9 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccm2Q8K2Y9 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccm2Q8K2Y9 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccm2Q8K2Y9 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccm2Q8K2Y9 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccm2Q8K2Y9 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccm2Q8K2Y9 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccm2Q8K2Y9 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccm2Q8K2Y9 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccm2Q8K2Y9 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccm2Q8K2Y9 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccm2Q8K2Y9 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccm2Q8K2Y9 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccm2Q8K2Y9 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccm2Q8K2Y9 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccm2Q8K2Y9 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccm2Q8K2Y9 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccm2Q8K2Y9 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccm2Q8K2Y9 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccm2Q8K2Y9 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccm2Q8K2Y9 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccm2Q8K2Y9 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccm2Q8K2Y9 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccm2Q8K2Y9 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccm2Q8K2Y9 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccm2Q8K2Y9 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccm2Q8K2Y9 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccm2Q8K2Y9 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccm2Q8K2Y9 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccm2Q8K2Y9 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccm2Q8K2Y9 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccm2Q8K2Y9 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccm2Q8K2Y9 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccm2Q8K2Y9 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccm2Q8K2Y9 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccm2Q8K2Y9 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccm2Q8K2Y9 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccm2Q8K2Y9 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccm2Q8K2Y9 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccm2Q8K2Y9 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccm2Q8K2Y9 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccm2Q8K2Y9 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccm2Q8K2Y9 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccm2Q8K2Y9 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccm2Q8K2Y9 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccm2Q8K2Y9 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccm2Q8K2Y9 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccm2Q8K2Y9 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccm2Q8K2Y9 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccm2Q8K2Y9 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccm2Q8K2Y9 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccm2Q8K2Y9 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccm2Q8K2Y9 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccm2Q8K2Y9 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccm2Q8K2Y9 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccm2Q8K2Y9 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccm2Q8K2Y9 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccm2Q8K2Y9 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccm2Q8K2Y9 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccm2Q8K2Y9 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccm2Q8K2Y9 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccm2Q8K2Y9 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccm2Q8K2Y9 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccm2Q8K2Y9 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccm2Q8K2Y9 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccm2Q8K2Y9 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccm2Q8K2Y9 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms