Protein–RNA interactions for Protein: Q8K202

Polr1e, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1eQ8K202 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Polr1eQ8K202 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Polr1eQ8K202 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Polr1eQ8K202 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Polr1eQ8K202 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Polr1eQ8K202 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Polr1eQ8K202 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Polr1eQ8K202 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Polr1eQ8K202 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Polr1eQ8K202 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Polr1eQ8K202 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Polr1eQ8K202 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Polr1eQ8K202 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Polr1eQ8K202 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Polr1eQ8K202 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Polr1eQ8K202 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Polr1eQ8K202 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Polr1eQ8K202 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Polr1eQ8K202 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Polr1eQ8K202 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Polr1eQ8K202 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Polr1eQ8K202 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Polr1eQ8K202 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Polr1eQ8K202 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Polr1eQ8K202 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Polr1eQ8K202 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Polr1eQ8K202 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Polr1eQ8K202 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Polr1eQ8K202 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Polr1eQ8K202 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Polr1eQ8K202 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Polr1eQ8K202 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Polr1eQ8K202 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Polr1eQ8K202 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Polr1eQ8K202 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Polr1eQ8K202 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Polr1eQ8K202 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Polr1eQ8K202 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Polr1eQ8K202 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Polr1eQ8K202 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Polr1eQ8K202 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Polr1eQ8K202 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Polr1eQ8K202 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Polr1eQ8K202 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Polr1eQ8K202 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Polr1eQ8K202 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Polr1eQ8K202 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Polr1eQ8K202 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Polr1eQ8K202 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Polr1eQ8K202 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Polr1eQ8K202 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Polr1eQ8K202 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Polr1eQ8K202 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Polr1eQ8K202 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Polr1eQ8K202 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Polr1eQ8K202 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Polr1eQ8K202 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Polr1eQ8K202 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Polr1eQ8K202 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Polr1eQ8K202 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Polr1eQ8K202 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Polr1eQ8K202 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Polr1eQ8K202 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Polr1eQ8K202 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Polr1eQ8K202 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Polr1eQ8K202 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Polr1eQ8K202 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Polr1eQ8K202 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Polr1eQ8K202 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Polr1eQ8K202 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Polr1eQ8K202 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Polr1eQ8K202 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Polr1eQ8K202 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Polr1eQ8K202 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Polr1eQ8K202 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Polr1eQ8K202 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Polr1eQ8K202 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Polr1eQ8K202 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Polr1eQ8K202 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Polr1eQ8K202 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Polr1eQ8K202 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Polr1eQ8K202 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Polr1eQ8K202 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Polr1eQ8K202 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Polr1eQ8K202 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Polr1eQ8K202 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Polr1eQ8K202 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Polr1eQ8K202 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Polr1eQ8K202 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Polr1eQ8K202 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Polr1eQ8K202 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Polr1eQ8K202 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Polr1eQ8K202 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Polr1eQ8K202 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Polr1eQ8K202 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Polr1eQ8K202 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Polr1eQ8K202 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Polr1eQ8K202 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Polr1eQ8K202 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Polr1eQ8K202 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms