Protein–RNA interactions for Protein: Q8K099

Lrit1, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit1Q8K099 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrit1Q8K099 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrit1Q8K099 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrit1Q8K099 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrit1Q8K099 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrit1Q8K099 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrit1Q8K099 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrit1Q8K099 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrit1Q8K099 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrit1Q8K099 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrit1Q8K099 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lrit1Q8K099 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrit1Q8K099 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrit1Q8K099 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrit1Q8K099 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrit1Q8K099 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrit1Q8K099 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrit1Q8K099 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrit1Q8K099 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrit1Q8K099 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrit1Q8K099 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrit1Q8K099 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrit1Q8K099 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrit1Q8K099 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrit1Q8K099 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrit1Q8K099 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrit1Q8K099 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrit1Q8K099 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lrit1Q8K099 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrit1Q8K099 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrit1Q8K099 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrit1Q8K099 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrit1Q8K099 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrit1Q8K099 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrit1Q8K099 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrit1Q8K099 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrit1Q8K099 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrit1Q8K099 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrit1Q8K099 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrit1Q8K099 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrit1Q8K099 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrit1Q8K099 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrit1Q8K099 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrit1Q8K099 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrit1Q8K099 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lrit1Q8K099 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrit1Q8K099 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrit1Q8K099 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrit1Q8K099 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrit1Q8K099 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrit1Q8K099 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrit1Q8K099 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrit1Q8K099 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrit1Q8K099 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrit1Q8K099 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrit1Q8K099 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lrit1Q8K099 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrit1Q8K099 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrit1Q8K099 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrit1Q8K099 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrit1Q8K099 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrit1Q8K099 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrit1Q8K099 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrit1Q8K099 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrit1Q8K099 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrit1Q8K099 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrit1Q8K099 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrit1Q8K099 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrit1Q8K099 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrit1Q8K099 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrit1Q8K099 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrit1Q8K099 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrit1Q8K099 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lrit1Q8K099 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrit1Q8K099 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrit1Q8K099 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrit1Q8K099 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrit1Q8K099 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrit1Q8K099 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrit1Q8K099 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrit1Q8K099 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrit1Q8K099 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrit1Q8K099 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrit1Q8K099 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrit1Q8K099 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrit1Q8K099 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrit1Q8K099 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrit1Q8K099 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrit1Q8K099 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrit1Q8K099 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrit1Q8K099 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrit1Q8K099 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrit1Q8K099 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrit1Q8K099 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrit1Q8K099 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrit1Q8K099 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrit1Q8K099 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrit1Q8K099 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrit1Q8K099 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrit1Q8K099 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms