Protein–RNA interactions for Protein: Q8K045

Pkn3, Serine/threonine-protein kinase N3, mousemouse

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Length 878 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn3Q8K045 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pkn3Q8K045 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Pkn3Q8K045 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Pkn3Q8K045 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pkn3Q8K045 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pkn3Q8K045 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pkn3Q8K045 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pkn3Q8K045 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pkn3Q8K045 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pkn3Q8K045 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pkn3Q8K045 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pkn3Q8K045 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Pkn3Q8K045 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pkn3Q8K045 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pkn3Q8K045 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pkn3Q8K045 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pkn3Q8K045 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pkn3Q8K045 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pkn3Q8K045 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pkn3Q8K045 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pkn3Q8K045 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pkn3Q8K045 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pkn3Q8K045 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pkn3Q8K045 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pkn3Q8K045 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pkn3Q8K045 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pkn3Q8K045 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pkn3Q8K045 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pkn3Q8K045 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pkn3Q8K045 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Pkn3Q8K045 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pkn3Q8K045 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pkn3Q8K045 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pkn3Q8K045 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pkn3Q8K045 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pkn3Q8K045 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Pkn3Q8K045 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pkn3Q8K045 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pkn3Q8K045 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pkn3Q8K045 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pkn3Q8K045 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pkn3Q8K045 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pkn3Q8K045 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pkn3Q8K045 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pkn3Q8K045 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pkn3Q8K045 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pkn3Q8K045 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pkn3Q8K045 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pkn3Q8K045 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pkn3Q8K045 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pkn3Q8K045 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pkn3Q8K045 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pkn3Q8K045 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pkn3Q8K045 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pkn3Q8K045 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pkn3Q8K045 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pkn3Q8K045 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pkn3Q8K045 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pkn3Q8K045 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pkn3Q8K045 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pkn3Q8K045 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pkn3Q8K045 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Pkn3Q8K045 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pkn3Q8K045 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pkn3Q8K045 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pkn3Q8K045 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pkn3Q8K045 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pkn3Q8K045 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Pkn3Q8K045 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pkn3Q8K045 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pkn3Q8K045 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pkn3Q8K045 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pkn3Q8K045 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pkn3Q8K045 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pkn3Q8K045 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pkn3Q8K045 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pkn3Q8K045 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pkn3Q8K045 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pkn3Q8K045 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pkn3Q8K045 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pkn3Q8K045 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Pkn3Q8K045 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pkn3Q8K045 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pkn3Q8K045 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pkn3Q8K045 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pkn3Q8K045 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Pkn3Q8K045 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pkn3Q8K045 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pkn3Q8K045 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pkn3Q8K045 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pkn3Q8K045 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pkn3Q8K045 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pkn3Q8K045 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pkn3Q8K045 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Pkn3Q8K045 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pkn3Q8K045 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pkn3Q8K045 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Pkn3Q8K045 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pkn3Q8K045 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pkn3Q8K045 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms