Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZQ2

Afg3l2, AFG3-like protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l2Q8JZQ2 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Afg3l2Q8JZQ2 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Afg3l2Q8JZQ2 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Afg3l2Q8JZQ2 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Afg3l2Q8JZQ2 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Afg3l2Q8JZQ2 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Afg3l2Q8JZQ2 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Afg3l2Q8JZQ2 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Afg3l2Q8JZQ2 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Afg3l2Q8JZQ2 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Afg3l2Q8JZQ2 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Afg3l2Q8JZQ2 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Afg3l2Q8JZQ2 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Afg3l2Q8JZQ2 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Afg3l2Q8JZQ2 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Afg3l2Q8JZQ2 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Afg3l2Q8JZQ2 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Afg3l2Q8JZQ2 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Afg3l2Q8JZQ2 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Afg3l2Q8JZQ2 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Afg3l2Q8JZQ2 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Afg3l2Q8JZQ2 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Afg3l2Q8JZQ2 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Afg3l2Q8JZQ2 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Afg3l2Q8JZQ2 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Afg3l2Q8JZQ2 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Afg3l2Q8JZQ2 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Afg3l2Q8JZQ2 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Afg3l2Q8JZQ2 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Afg3l2Q8JZQ2 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Afg3l2Q8JZQ2 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Afg3l2Q8JZQ2 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Afg3l2Q8JZQ2 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Afg3l2Q8JZQ2 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Afg3l2Q8JZQ2 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Afg3l2Q8JZQ2 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Afg3l2Q8JZQ2 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Afg3l2Q8JZQ2 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Afg3l2Q8JZQ2 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Afg3l2Q8JZQ2 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Afg3l2Q8JZQ2 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Afg3l2Q8JZQ2 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Afg3l2Q8JZQ2 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Afg3l2Q8JZQ2 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Afg3l2Q8JZQ2 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Afg3l2Q8JZQ2 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Afg3l2Q8JZQ2 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Afg3l2Q8JZQ2 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Afg3l2Q8JZQ2 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Afg3l2Q8JZQ2 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Afg3l2Q8JZQ2 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Afg3l2Q8JZQ2 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Afg3l2Q8JZQ2 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Afg3l2Q8JZQ2 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Afg3l2Q8JZQ2 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Afg3l2Q8JZQ2 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Afg3l2Q8JZQ2 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Afg3l2Q8JZQ2 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Afg3l2Q8JZQ2 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Afg3l2Q8JZQ2 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Afg3l2Q8JZQ2 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Afg3l2Q8JZQ2 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Afg3l2Q8JZQ2 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Afg3l2Q8JZQ2 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Afg3l2Q8JZQ2 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Afg3l2Q8JZQ2 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Afg3l2Q8JZQ2 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Afg3l2Q8JZQ2 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Afg3l2Q8JZQ2 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Afg3l2Q8JZQ2 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Afg3l2Q8JZQ2 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Afg3l2Q8JZQ2 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Afg3l2Q8JZQ2 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Afg3l2Q8JZQ2 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Afg3l2Q8JZQ2 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Afg3l2Q8JZQ2 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Afg3l2Q8JZQ2 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Afg3l2Q8JZQ2 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Afg3l2Q8JZQ2 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Afg3l2Q8JZQ2 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Afg3l2Q8JZQ2 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Afg3l2Q8JZQ2 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Afg3l2Q8JZQ2 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Afg3l2Q8JZQ2 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Afg3l2Q8JZQ2 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Afg3l2Q8JZQ2 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Afg3l2Q8JZQ2 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Afg3l2Q8JZQ2 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Afg3l2Q8JZQ2 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Afg3l2Q8JZQ2 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Afg3l2Q8JZQ2 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Afg3l2Q8JZQ2 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Afg3l2Q8JZQ2 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Afg3l2Q8JZQ2 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Afg3l2Q8JZQ2 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Afg3l2Q8JZQ2 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Afg3l2Q8JZQ2 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Afg3l2Q8JZQ2 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Afg3l2Q8JZQ2 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Afg3l2Q8JZQ2 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms