Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf628Q8CJ78 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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Znf628Q8CJ78 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17■□□□□ 0.31
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Znf628Q8CJ78 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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Znf628Q8CJ78 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Znf628Q8CJ78 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Znf628Q8CJ78 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Znf628Q8CJ78 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Znf628Q8CJ78 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Znf628Q8CJ78 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Znf628Q8CJ78 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Znf628Q8CJ78 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Znf628Q8CJ78 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Znf628Q8CJ78 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Znf628Q8CJ78 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Znf628Q8CJ78 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Znf628Q8CJ78 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Znf628Q8CJ78 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Znf628Q8CJ78 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Znf628Q8CJ78 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Znf628Q8CJ78 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Znf628Q8CJ78 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Znf628Q8CJ78 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Znf628Q8CJ78 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Znf628Q8CJ78 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms