Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGA3

Slc43a2, Large neutral amino acids transporter small subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc43a2Q8CGA3 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc43a2Q8CGA3 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc43a2Q8CGA3 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc43a2Q8CGA3 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc43a2Q8CGA3 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc43a2Q8CGA3 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc43a2Q8CGA3 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc43a2Q8CGA3 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc43a2Q8CGA3 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc43a2Q8CGA3 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc43a2Q8CGA3 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc43a2Q8CGA3 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc43a2Q8CGA3 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc43a2Q8CGA3 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc43a2Q8CGA3 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc43a2Q8CGA3 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc43a2Q8CGA3 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc43a2Q8CGA3 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc43a2Q8CGA3 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Slc43a2Q8CGA3 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc43a2Q8CGA3 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc43a2Q8CGA3 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc43a2Q8CGA3 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc43a2Q8CGA3 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc43a2Q8CGA3 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc43a2Q8CGA3 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc43a2Q8CGA3 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc43a2Q8CGA3 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc43a2Q8CGA3 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc43a2Q8CGA3 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc43a2Q8CGA3 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc43a2Q8CGA3 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc43a2Q8CGA3 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc43a2Q8CGA3 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc43a2Q8CGA3 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc43a2Q8CGA3 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc43a2Q8CGA3 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc43a2Q8CGA3 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Slc43a2Q8CGA3 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc43a2Q8CGA3 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc43a2Q8CGA3 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc43a2Q8CGA3 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc43a2Q8CGA3 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc43a2Q8CGA3 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc43a2Q8CGA3 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Slc43a2Q8CGA3 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc43a2Q8CGA3 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc43a2Q8CGA3 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc43a2Q8CGA3 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc43a2Q8CGA3 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc43a2Q8CGA3 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc43a2Q8CGA3 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc43a2Q8CGA3 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc43a2Q8CGA3 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc43a2Q8CGA3 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Slc43a2Q8CGA3 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc43a2Q8CGA3 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc43a2Q8CGA3 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc43a2Q8CGA3 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc43a2Q8CGA3 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc43a2Q8CGA3 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc43a2Q8CGA3 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc43a2Q8CGA3 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc43a2Q8CGA3 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc43a2Q8CGA3 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc43a2Q8CGA3 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc43a2Q8CGA3 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc43a2Q8CGA3 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc43a2Q8CGA3 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc43a2Q8CGA3 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc43a2Q8CGA3 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc43a2Q8CGA3 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc43a2Q8CGA3 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc43a2Q8CGA3 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc43a2Q8CGA3 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc43a2Q8CGA3 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc43a2Q8CGA3 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc43a2Q8CGA3 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc43a2Q8CGA3 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc43a2Q8CGA3 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc43a2Q8CGA3 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Slc43a2Q8CGA3 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc43a2Q8CGA3 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc43a2Q8CGA3 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc43a2Q8CGA3 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc43a2Q8CGA3 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc43a2Q8CGA3 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc43a2Q8CGA3 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc43a2Q8CGA3 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc43a2Q8CGA3 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc43a2Q8CGA3 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc43a2Q8CGA3 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc43a2Q8CGA3 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc43a2Q8CGA3 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc43a2Q8CGA3 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc43a2Q8CGA3 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc43a2Q8CGA3 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc43a2Q8CGA3 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc43a2Q8CGA3 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Slc43a2Q8CGA3 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms