Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFT2

Setd1b, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, mousemouse

Predictions only

Length 1,985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd1bQ8CFT2 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Setd1bQ8CFT2 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Setd1bQ8CFT2 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Setd1bQ8CFT2 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Setd1bQ8CFT2 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Setd1bQ8CFT2 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Setd1bQ8CFT2 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Setd1bQ8CFT2 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Setd1bQ8CFT2 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Setd1bQ8CFT2 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Setd1bQ8CFT2 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Setd1bQ8CFT2 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Setd1bQ8CFT2 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Setd1bQ8CFT2 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Setd1bQ8CFT2 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Setd1bQ8CFT2 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Setd1bQ8CFT2 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Setd1bQ8CFT2 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Setd1bQ8CFT2 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Setd1bQ8CFT2 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Setd1bQ8CFT2 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Setd1bQ8CFT2 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Setd1bQ8CFT2 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Setd1bQ8CFT2 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Setd1bQ8CFT2 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Setd1bQ8CFT2 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Setd1bQ8CFT2 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Setd1bQ8CFT2 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Setd1bQ8CFT2 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Setd1bQ8CFT2 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Setd1bQ8CFT2 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Setd1bQ8CFT2 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Setd1bQ8CFT2 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Setd1bQ8CFT2 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Setd1bQ8CFT2 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Setd1bQ8CFT2 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Setd1bQ8CFT2 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Setd1bQ8CFT2 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Setd1bQ8CFT2 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Setd1bQ8CFT2 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Setd1bQ8CFT2 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Setd1bQ8CFT2 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Setd1bQ8CFT2 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Setd1bQ8CFT2 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Setd1bQ8CFT2 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Setd1bQ8CFT2 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Setd1bQ8CFT2 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Setd1bQ8CFT2 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Setd1bQ8CFT2 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Setd1bQ8CFT2 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Setd1bQ8CFT2 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Setd1bQ8CFT2 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Setd1bQ8CFT2 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Setd1bQ8CFT2 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Setd1bQ8CFT2 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Setd1bQ8CFT2 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Setd1bQ8CFT2 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Setd1bQ8CFT2 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Setd1bQ8CFT2 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Setd1bQ8CFT2 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Setd1bQ8CFT2 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Setd1bQ8CFT2 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Setd1bQ8CFT2 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Setd1bQ8CFT2 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Setd1bQ8CFT2 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Setd1bQ8CFT2 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Setd1bQ8CFT2 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Setd1bQ8CFT2 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Setd1bQ8CFT2 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Setd1bQ8CFT2 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Setd1bQ8CFT2 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Setd1bQ8CFT2 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Setd1bQ8CFT2 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Setd1bQ8CFT2 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
Setd1bQ8CFT2 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Setd1bQ8CFT2 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Setd1bQ8CFT2 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Setd1bQ8CFT2 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Setd1bQ8CFT2 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Setd1bQ8CFT2 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Setd1bQ8CFT2 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Setd1bQ8CFT2 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Setd1bQ8CFT2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Setd1bQ8CFT2 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Setd1bQ8CFT2 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Setd1bQ8CFT2 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Setd1bQ8CFT2 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Setd1bQ8CFT2 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Setd1bQ8CFT2 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Setd1bQ8CFT2 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Setd1bQ8CFT2 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Setd1bQ8CFT2 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Setd1bQ8CFT2 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Setd1bQ8CFT2 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Setd1bQ8CFT2 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Setd1bQ8CFT2 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Setd1bQ8CFT2 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Setd1bQ8CFT2 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Setd1bQ8CFT2 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Setd1bQ8CFT2 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms