Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdkl1Q8CEQ0 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cdkl1Q8CEQ0 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Cdkl1Q8CEQ0 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cdkl1Q8CEQ0 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cdkl1Q8CEQ0 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cdkl1Q8CEQ0 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cdkl1Q8CEQ0 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cdkl1Q8CEQ0 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Cdkl1Q8CEQ0 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdkl1Q8CEQ0 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdkl1Q8CEQ0 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdkl1Q8CEQ0 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdkl1Q8CEQ0 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdkl1Q8CEQ0 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdkl1Q8CEQ0 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdkl1Q8CEQ0 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms