Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEI1

Bola3, BolA-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bola3Q8CEI1 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Bola3Q8CEI1 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Bola3Q8CEI1 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Bola3Q8CEI1 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Bola3Q8CEI1 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Bola3Q8CEI1 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Bola3Q8CEI1 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Bola3Q8CEI1 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Bola3Q8CEI1 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Bola3Q8CEI1 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Bola3Q8CEI1 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Bola3Q8CEI1 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Bola3Q8CEI1 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Bola3Q8CEI1 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Bola3Q8CEI1 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Bola3Q8CEI1 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Bola3Q8CEI1 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Bola3Q8CEI1 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Bola3Q8CEI1 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Bola3Q8CEI1 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Bola3Q8CEI1 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Bola3Q8CEI1 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Bola3Q8CEI1 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Bola3Q8CEI1 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Bola3Q8CEI1 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Bola3Q8CEI1 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Bola3Q8CEI1 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Bola3Q8CEI1 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Bola3Q8CEI1 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Bola3Q8CEI1 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Bola3Q8CEI1 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Bola3Q8CEI1 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Bola3Q8CEI1 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Bola3Q8CEI1 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Bola3Q8CEI1 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Bola3Q8CEI1 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Bola3Q8CEI1 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Bola3Q8CEI1 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Bola3Q8CEI1 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Bola3Q8CEI1 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Bola3Q8CEI1 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Bola3Q8CEI1 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Bola3Q8CEI1 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Bola3Q8CEI1 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Bola3Q8CEI1 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Bola3Q8CEI1 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Bola3Q8CEI1 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Bola3Q8CEI1 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Bola3Q8CEI1 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Bola3Q8CEI1 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Bola3Q8CEI1 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Bola3Q8CEI1 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Bola3Q8CEI1 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Bola3Q8CEI1 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Bola3Q8CEI1 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Bola3Q8CEI1 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Bola3Q8CEI1 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Bola3Q8CEI1 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Bola3Q8CEI1 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Bola3Q8CEI1 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Bola3Q8CEI1 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Bola3Q8CEI1 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Bola3Q8CEI1 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Bola3Q8CEI1 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Bola3Q8CEI1 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Bola3Q8CEI1 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Bola3Q8CEI1 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Bola3Q8CEI1 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Bola3Q8CEI1 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Bola3Q8CEI1 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Bola3Q8CEI1 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Bola3Q8CEI1 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Bola3Q8CEI1 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Bola3Q8CEI1 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Bola3Q8CEI1 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Bola3Q8CEI1 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Bola3Q8CEI1 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Bola3Q8CEI1 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Bola3Q8CEI1 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Bola3Q8CEI1 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Bola3Q8CEI1 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Bola3Q8CEI1 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Bola3Q8CEI1 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Bola3Q8CEI1 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Bola3Q8CEI1 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Bola3Q8CEI1 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Bola3Q8CEI1 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Bola3Q8CEI1 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Bola3Q8CEI1 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Bola3Q8CEI1 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Bola3Q8CEI1 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Bola3Q8CEI1 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Bola3Q8CEI1 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Bola3Q8CEI1 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Bola3Q8CEI1 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Bola3Q8CEI1 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Bola3Q8CEI1 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Bola3Q8CEI1 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Bola3Q8CEI1 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Bola3Q8CEI1 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms