Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC5

Nkiras1, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkiras1Q8CEC5 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nkiras1Q8CEC5 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nkiras1Q8CEC5 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Nkiras1Q8CEC5 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Nkiras1Q8CEC5 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Nkiras1Q8CEC5 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nkiras1Q8CEC5 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nkiras1Q8CEC5 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nkiras1Q8CEC5 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nkiras1Q8CEC5 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nkiras1Q8CEC5 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nkiras1Q8CEC5 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nkiras1Q8CEC5 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nkiras1Q8CEC5 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nkiras1Q8CEC5 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nkiras1Q8CEC5 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nkiras1Q8CEC5 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nkiras1Q8CEC5 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nkiras1Q8CEC5 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nkiras1Q8CEC5 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nkiras1Q8CEC5 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nkiras1Q8CEC5 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Nkiras1Q8CEC5 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nkiras1Q8CEC5 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nkiras1Q8CEC5 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nkiras1Q8CEC5 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nkiras1Q8CEC5 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nkiras1Q8CEC5 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nkiras1Q8CEC5 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nkiras1Q8CEC5 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nkiras1Q8CEC5 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nkiras1Q8CEC5 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nkiras1Q8CEC5 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nkiras1Q8CEC5 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nkiras1Q8CEC5 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nkiras1Q8CEC5 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nkiras1Q8CEC5 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nkiras1Q8CEC5 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Nkiras1Q8CEC5 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Nkiras1Q8CEC5 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nkiras1Q8CEC5 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nkiras1Q8CEC5 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nkiras1Q8CEC5 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nkiras1Q8CEC5 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Nkiras1Q8CEC5 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Nkiras1Q8CEC5 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Nkiras1Q8CEC5 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Nkiras1Q8CEC5 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Nkiras1Q8CEC5 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkiras1Q8CEC5 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkiras1Q8CEC5 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkiras1Q8CEC5 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkiras1Q8CEC5 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkiras1Q8CEC5 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkiras1Q8CEC5 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkiras1Q8CEC5 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkiras1Q8CEC5 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkiras1Q8CEC5 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkiras1Q8CEC5 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkiras1Q8CEC5 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkiras1Q8CEC5 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkiras1Q8CEC5 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkiras1Q8CEC5 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkiras1Q8CEC5 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkiras1Q8CEC5 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkiras1Q8CEC5 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkiras1Q8CEC5 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkiras1Q8CEC5 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nkiras1Q8CEC5 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nkiras1Q8CEC5 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nkiras1Q8CEC5 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Nkiras1Q8CEC5 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nkiras1Q8CEC5 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nkiras1Q8CEC5 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Nkiras1Q8CEC5 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nkiras1Q8CEC5 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nkiras1Q8CEC5 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nkiras1Q8CEC5 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nkiras1Q8CEC5 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nkiras1Q8CEC5 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nkiras1Q8CEC5 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nkiras1Q8CEC5 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nkiras1Q8CEC5 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nkiras1Q8CEC5 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nkiras1Q8CEC5 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nkiras1Q8CEC5 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nkiras1Q8CEC5 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nkiras1Q8CEC5 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nkiras1Q8CEC5 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Nkiras1Q8CEC5 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nkiras1Q8CEC5 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nkiras1Q8CEC5 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nkiras1Q8CEC5 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nkiras1Q8CEC5 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nkiras1Q8CEC5 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nkiras1Q8CEC5 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nkiras1Q8CEC5 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nkiras1Q8CEC5 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nkiras1Q8CEC5 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nkiras1Q8CEC5 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms