Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE33

Klhl11, Kelch-like protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl11Q8CE33 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klhl11Q8CE33 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Klhl11Q8CE33 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Klhl11Q8CE33 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klhl11Q8CE33 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klhl11Q8CE33 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klhl11Q8CE33 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klhl11Q8CE33 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klhl11Q8CE33 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klhl11Q8CE33 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klhl11Q8CE33 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klhl11Q8CE33 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klhl11Q8CE33 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klhl11Q8CE33 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Klhl11Q8CE33 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klhl11Q8CE33 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Klhl11Q8CE33 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klhl11Q8CE33 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Klhl11Q8CE33 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klhl11Q8CE33 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Klhl11Q8CE33 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Klhl11Q8CE33 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Klhl11Q8CE33 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Klhl11Q8CE33 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Klhl11Q8CE33 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Klhl11Q8CE33 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Klhl11Q8CE33 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Klhl11Q8CE33 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Klhl11Q8CE33 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Klhl11Q8CE33 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Klhl11Q8CE33 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Klhl11Q8CE33 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Klhl11Q8CE33 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Klhl11Q8CE33 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Klhl11Q8CE33 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Klhl11Q8CE33 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Klhl11Q8CE33 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Klhl11Q8CE33 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Klhl11Q8CE33 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Klhl11Q8CE33 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Klhl11Q8CE33 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Klhl11Q8CE33 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Klhl11Q8CE33 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Klhl11Q8CE33 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Klhl11Q8CE33 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Klhl11Q8CE33 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Klhl11Q8CE33 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Klhl11Q8CE33 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Klhl11Q8CE33 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Klhl11Q8CE33 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Klhl11Q8CE33 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Klhl11Q8CE33 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Klhl11Q8CE33 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Klhl11Q8CE33 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Klhl11Q8CE33 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Klhl11Q8CE33 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Klhl11Q8CE33 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Klhl11Q8CE33 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Klhl11Q8CE33 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Klhl11Q8CE33 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Klhl11Q8CE33 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Klhl11Q8CE33 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Klhl11Q8CE33 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Klhl11Q8CE33 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Klhl11Q8CE33 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Klhl11Q8CE33 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Klhl11Q8CE33 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Klhl11Q8CE33 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Klhl11Q8CE33 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Klhl11Q8CE33 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Klhl11Q8CE33 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Klhl11Q8CE33 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Klhl11Q8CE33 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Klhl11Q8CE33 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Klhl11Q8CE33 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Klhl11Q8CE33 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Klhl11Q8CE33 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Klhl11Q8CE33 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Klhl11Q8CE33 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Klhl11Q8CE33 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Klhl11Q8CE33 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Klhl11Q8CE33 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Klhl11Q8CE33 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Klhl11Q8CE33 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Klhl11Q8CE33 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Klhl11Q8CE33 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Klhl11Q8CE33 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Klhl11Q8CE33 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Klhl11Q8CE33 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Klhl11Q8CE33 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Klhl11Q8CE33 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Klhl11Q8CE33 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Klhl11Q8CE33 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Klhl11Q8CE33 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Klhl11Q8CE33 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Klhl11Q8CE33 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Klhl11Q8CE33 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Klhl11Q8CE33 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Klhl11Q8CE33 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Klhl11Q8CE33 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms