Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV0

Ccdc178, Coiled-coil domain-containing protein 178, mousemouse

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc178Q8CDV0 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc178Q8CDV0 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc178Q8CDV0 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc178Q8CDV0 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc178Q8CDV0 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc178Q8CDV0 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc178Q8CDV0 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc178Q8CDV0 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc178Q8CDV0 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc178Q8CDV0 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc178Q8CDV0 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc178Q8CDV0 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc178Q8CDV0 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc178Q8CDV0 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc178Q8CDV0 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc178Q8CDV0 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc178Q8CDV0 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc178Q8CDV0 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc178Q8CDV0 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc178Q8CDV0 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc178Q8CDV0 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc178Q8CDV0 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc178Q8CDV0 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc178Q8CDV0 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc178Q8CDV0 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc178Q8CDV0 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc178Q8CDV0 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc178Q8CDV0 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc178Q8CDV0 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc178Q8CDV0 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc178Q8CDV0 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc178Q8CDV0 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc178Q8CDV0 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc178Q8CDV0 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc178Q8CDV0 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc178Q8CDV0 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc178Q8CDV0 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc178Q8CDV0 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc178Q8CDV0 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc178Q8CDV0 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc178Q8CDV0 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc178Q8CDV0 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc178Q8CDV0 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc178Q8CDV0 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc178Q8CDV0 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc178Q8CDV0 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc178Q8CDV0 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc178Q8CDV0 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc178Q8CDV0 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc178Q8CDV0 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc178Q8CDV0 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc178Q8CDV0 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc178Q8CDV0 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc178Q8CDV0 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc178Q8CDV0 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc178Q8CDV0 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc178Q8CDV0 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc178Q8CDV0 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc178Q8CDV0 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc178Q8CDV0 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc178Q8CDV0 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc178Q8CDV0 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc178Q8CDV0 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc178Q8CDV0 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc178Q8CDV0 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc178Q8CDV0 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc178Q8CDV0 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc178Q8CDV0 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc178Q8CDV0 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc178Q8CDV0 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc178Q8CDV0 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc178Q8CDV0 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc178Q8CDV0 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc178Q8CDV0 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc178Q8CDV0 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc178Q8CDV0 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc178Q8CDV0 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc178Q8CDV0 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc178Q8CDV0 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc178Q8CDV0 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc178Q8CDV0 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc178Q8CDV0 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc178Q8CDV0 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc178Q8CDV0 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc178Q8CDV0 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc178Q8CDV0 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc178Q8CDV0 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc178Q8CDV0 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc178Q8CDV0 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc178Q8CDV0 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc178Q8CDV0 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc178Q8CDV0 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc178Q8CDV0 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc178Q8CDV0 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc178Q8CDV0 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc178Q8CDV0 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc178Q8CDV0 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc178Q8CDV0 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc178Q8CDV0 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc178Q8CDV0 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms