Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6A8

Bhlhe22, Class E basic helix-loop-helix protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe22Q8C6A8 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bhlhe22Q8C6A8 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bhlhe22Q8C6A8 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bhlhe22Q8C6A8 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bhlhe22Q8C6A8 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bhlhe22Q8C6A8 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bhlhe22Q8C6A8 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bhlhe22Q8C6A8 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bhlhe22Q8C6A8 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bhlhe22Q8C6A8 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bhlhe22Q8C6A8 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bhlhe22Q8C6A8 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bhlhe22Q8C6A8 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Bhlhe22Q8C6A8 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Bhlhe22Q8C6A8 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Bhlhe22Q8C6A8 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bhlhe22Q8C6A8 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bhlhe22Q8C6A8 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bhlhe22Q8C6A8 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bhlhe22Q8C6A8 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bhlhe22Q8C6A8 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bhlhe22Q8C6A8 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bhlhe22Q8C6A8 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bhlhe22Q8C6A8 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bhlhe22Q8C6A8 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bhlhe22Q8C6A8 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bhlhe22Q8C6A8 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bhlhe22Q8C6A8 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bhlhe22Q8C6A8 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bhlhe22Q8C6A8 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bhlhe22Q8C6A8 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bhlhe22Q8C6A8 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bhlhe22Q8C6A8 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bhlhe22Q8C6A8 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bhlhe22Q8C6A8 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bhlhe22Q8C6A8 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bhlhe22Q8C6A8 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bhlhe22Q8C6A8 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bhlhe22Q8C6A8 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Bhlhe22Q8C6A8 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bhlhe22Q8C6A8 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bhlhe22Q8C6A8 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bhlhe22Q8C6A8 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bhlhe22Q8C6A8 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bhlhe22Q8C6A8 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bhlhe22Q8C6A8 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bhlhe22Q8C6A8 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bhlhe22Q8C6A8 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bhlhe22Q8C6A8 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bhlhe22Q8C6A8 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bhlhe22Q8C6A8 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bhlhe22Q8C6A8 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bhlhe22Q8C6A8 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bhlhe22Q8C6A8 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bhlhe22Q8C6A8 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bhlhe22Q8C6A8 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bhlhe22Q8C6A8 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bhlhe22Q8C6A8 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bhlhe22Q8C6A8 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bhlhe22Q8C6A8 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bhlhe22Q8C6A8 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bhlhe22Q8C6A8 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bhlhe22Q8C6A8 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bhlhe22Q8C6A8 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Bhlhe22Q8C6A8 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bhlhe22Q8C6A8 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bhlhe22Q8C6A8 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bhlhe22Q8C6A8 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bhlhe22Q8C6A8 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bhlhe22Q8C6A8 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bhlhe22Q8C6A8 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bhlhe22Q8C6A8 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bhlhe22Q8C6A8 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bhlhe22Q8C6A8 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bhlhe22Q8C6A8 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bhlhe22Q8C6A8 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bhlhe22Q8C6A8 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bhlhe22Q8C6A8 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bhlhe22Q8C6A8 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bhlhe22Q8C6A8 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bhlhe22Q8C6A8 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bhlhe22Q8C6A8 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bhlhe22Q8C6A8 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Bhlhe22Q8C6A8 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bhlhe22Q8C6A8 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bhlhe22Q8C6A8 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bhlhe22Q8C6A8 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bhlhe22Q8C6A8 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bhlhe22Q8C6A8 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bhlhe22Q8C6A8 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Bhlhe22Q8C6A8 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bhlhe22Q8C6A8 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bhlhe22Q8C6A8 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bhlhe22Q8C6A8 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bhlhe22Q8C6A8 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bhlhe22Q8C6A8 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bhlhe22Q8C6A8 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bhlhe22Q8C6A8 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bhlhe22Q8C6A8 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bhlhe22Q8C6A8 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms