Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U9

Ubqln3, Ubiquilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln3Q8C5U9 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ubqln3Q8C5U9 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubqln3Q8C5U9 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ubqln3Q8C5U9 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ubqln3Q8C5U9 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ubqln3Q8C5U9 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubqln3Q8C5U9 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubqln3Q8C5U9 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubqln3Q8C5U9 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubqln3Q8C5U9 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ubqln3Q8C5U9 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ubqln3Q8C5U9 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubqln3Q8C5U9 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubqln3Q8C5U9 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubqln3Q8C5U9 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ubqln3Q8C5U9 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ubqln3Q8C5U9 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubqln3Q8C5U9 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ubqln3Q8C5U9 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubqln3Q8C5U9 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ubqln3Q8C5U9 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubqln3Q8C5U9 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ubqln3Q8C5U9 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ubqln3Q8C5U9 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ubqln3Q8C5U9 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ubqln3Q8C5U9 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ubqln3Q8C5U9 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Ubqln3Q8C5U9 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ubqln3Q8C5U9 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Ubqln3Q8C5U9 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ubqln3Q8C5U9 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ubqln3Q8C5U9 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ubqln3Q8C5U9 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ubqln3Q8C5U9 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ubqln3Q8C5U9 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ubqln3Q8C5U9 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ubqln3Q8C5U9 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ubqln3Q8C5U9 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ubqln3Q8C5U9 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ubqln3Q8C5U9 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ubqln3Q8C5U9 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ubqln3Q8C5U9 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ubqln3Q8C5U9 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ubqln3Q8C5U9 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ubqln3Q8C5U9 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ubqln3Q8C5U9 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ubqln3Q8C5U9 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ubqln3Q8C5U9 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubqln3Q8C5U9 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ubqln3Q8C5U9 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubqln3Q8C5U9 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ubqln3Q8C5U9 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubqln3Q8C5U9 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ubqln3Q8C5U9 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ubqln3Q8C5U9 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ubqln3Q8C5U9 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ubqln3Q8C5U9 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubqln3Q8C5U9 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ubqln3Q8C5U9 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ubqln3Q8C5U9 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ubqln3Q8C5U9 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ubqln3Q8C5U9 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ubqln3Q8C5U9 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ubqln3Q8C5U9 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ubqln3Q8C5U9 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ubqln3Q8C5U9 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ubqln3Q8C5U9 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ubqln3Q8C5U9 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ubqln3Q8C5U9 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ubqln3Q8C5U9 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ubqln3Q8C5U9 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ubqln3Q8C5U9 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ubqln3Q8C5U9 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ubqln3Q8C5U9 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ubqln3Q8C5U9 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ubqln3Q8C5U9 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Ubqln3Q8C5U9 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ubqln3Q8C5U9 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Ubqln3Q8C5U9 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ubqln3Q8C5U9 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ubqln3Q8C5U9 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ubqln3Q8C5U9 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ubqln3Q8C5U9 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ubqln3Q8C5U9 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ubqln3Q8C5U9 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ubqln3Q8C5U9 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ubqln3Q8C5U9 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ubqln3Q8C5U9 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ubqln3Q8C5U9 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ubqln3Q8C5U9 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Ubqln3Q8C5U9 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ubqln3Q8C5U9 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ubqln3Q8C5U9 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ubqln3Q8C5U9 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Ubqln3Q8C5U9 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ubqln3Q8C5U9 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ubqln3Q8C5U9 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ubqln3Q8C5U9 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ubqln3Q8C5U9 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Ubqln3Q8C5U9 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms