Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5N3

Cwc22, Pre-mRNA-splicing factor CWC22 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cwc22Q8C5N3 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cwc22Q8C5N3 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cwc22Q8C5N3 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cwc22Q8C5N3 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cwc22Q8C5N3 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cwc22Q8C5N3 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cwc22Q8C5N3 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cwc22Q8C5N3 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cwc22Q8C5N3 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cwc22Q8C5N3 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Cwc22Q8C5N3 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cwc22Q8C5N3 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cwc22Q8C5N3 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cwc22Q8C5N3 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cwc22Q8C5N3 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cwc22Q8C5N3 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cwc22Q8C5N3 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cwc22Q8C5N3 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cwc22Q8C5N3 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cwc22Q8C5N3 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cwc22Q8C5N3 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cwc22Q8C5N3 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cwc22Q8C5N3 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cwc22Q8C5N3 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Cwc22Q8C5N3 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cwc22Q8C5N3 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cwc22Q8C5N3 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cwc22Q8C5N3 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cwc22Q8C5N3 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cwc22Q8C5N3 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cwc22Q8C5N3 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cwc22Q8C5N3 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cwc22Q8C5N3 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cwc22Q8C5N3 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cwc22Q8C5N3 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cwc22Q8C5N3 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cwc22Q8C5N3 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cwc22Q8C5N3 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cwc22Q8C5N3 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cwc22Q8C5N3 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Cwc22Q8C5N3 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cwc22Q8C5N3 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cwc22Q8C5N3 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cwc22Q8C5N3 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cwc22Q8C5N3 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Cwc22Q8C5N3 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cwc22Q8C5N3 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cwc22Q8C5N3 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cwc22Q8C5N3 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cwc22Q8C5N3 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cwc22Q8C5N3 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cwc22Q8C5N3 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cwc22Q8C5N3 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cwc22Q8C5N3 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cwc22Q8C5N3 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cwc22Q8C5N3 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cwc22Q8C5N3 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cwc22Q8C5N3 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cwc22Q8C5N3 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cwc22Q8C5N3 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cwc22Q8C5N3 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cwc22Q8C5N3 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Cwc22Q8C5N3 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cwc22Q8C5N3 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cwc22Q8C5N3 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cwc22Q8C5N3 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cwc22Q8C5N3 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cwc22Q8C5N3 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cwc22Q8C5N3 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cwc22Q8C5N3 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cwc22Q8C5N3 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cwc22Q8C5N3 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cwc22Q8C5N3 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cwc22Q8C5N3 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cwc22Q8C5N3 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cwc22Q8C5N3 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cwc22Q8C5N3 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cwc22Q8C5N3 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cwc22Q8C5N3 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cwc22Q8C5N3 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cwc22Q8C5N3 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cwc22Q8C5N3 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Cwc22Q8C5N3 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Cwc22Q8C5N3 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cwc22Q8C5N3 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cwc22Q8C5N3 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cwc22Q8C5N3 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cwc22Q8C5N3 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cwc22Q8C5N3 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cwc22Q8C5N3 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Cwc22Q8C5N3 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cwc22Q8C5N3 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cwc22Q8C5N3 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cwc22Q8C5N3 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cwc22Q8C5N3 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cwc22Q8C5N3 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cwc22Q8C5N3 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cwc22Q8C5N3 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cwc22Q8C5N3 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cwc22Q8C5N3 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms