Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C4

Ccser1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser1Q8C0C4 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccser1Q8C0C4 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccser1Q8C0C4 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccser1Q8C0C4 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccser1Q8C0C4 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccser1Q8C0C4 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccser1Q8C0C4 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccser1Q8C0C4 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccser1Q8C0C4 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccser1Q8C0C4 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccser1Q8C0C4 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccser1Q8C0C4 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccser1Q8C0C4 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccser1Q8C0C4 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccser1Q8C0C4 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccser1Q8C0C4 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccser1Q8C0C4 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ccser1Q8C0C4 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccser1Q8C0C4 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccser1Q8C0C4 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccser1Q8C0C4 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccser1Q8C0C4 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccser1Q8C0C4 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccser1Q8C0C4 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccser1Q8C0C4 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccser1Q8C0C4 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccser1Q8C0C4 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccser1Q8C0C4 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccser1Q8C0C4 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccser1Q8C0C4 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccser1Q8C0C4 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccser1Q8C0C4 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccser1Q8C0C4 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccser1Q8C0C4 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccser1Q8C0C4 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccser1Q8C0C4 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccser1Q8C0C4 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccser1Q8C0C4 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccser1Q8C0C4 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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Ccser1Q8C0C4 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccser1Q8C0C4 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccser1Q8C0C4 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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Ccser1Q8C0C4 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccser1Q8C0C4 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccser1Q8C0C4 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccser1Q8C0C4 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccser1Q8C0C4 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccser1Q8C0C4 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccser1Q8C0C4 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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Ccser1Q8C0C4 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccser1Q8C0C4 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccser1Q8C0C4 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccser1Q8C0C4 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccser1Q8C0C4 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccser1Q8C0C4 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccser1Q8C0C4 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
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Ccser1Q8C0C4 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
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Ccser1Q8C0C4 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
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Ccser1Q8C0C4 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccser1Q8C0C4 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccser1Q8C0C4 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccser1Q8C0C4 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccser1Q8C0C4 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccser1Q8C0C4 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccser1Q8C0C4 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccser1Q8C0C4 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccser1Q8C0C4 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccser1Q8C0C4 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccser1Q8C0C4 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccser1Q8C0C4 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccser1Q8C0C4 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccser1Q8C0C4 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccser1Q8C0C4 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccser1Q8C0C4 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccser1Q8C0C4 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccser1Q8C0C4 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccser1Q8C0C4 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccser1Q8C0C4 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccser1Q8C0C4 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccser1Q8C0C4 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccser1Q8C0C4 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccser1Q8C0C4 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccser1Q8C0C4 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccser1Q8C0C4 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccser1Q8C0C4 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccser1Q8C0C4 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccser1Q8C0C4 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccser1Q8C0C4 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
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