Protein–RNA interactions for Protein: Q8C080

Snx16, Sorting nexin-16, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx16Q8C080 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Snx16Q8C080 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Snx16Q8C080 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snx16Q8C080 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Snx16Q8C080 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Snx16Q8C080 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Snx16Q8C080 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snx16Q8C080 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snx16Q8C080 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snx16Q8C080 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
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Snx16Q8C080 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snx16Q8C080 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snx16Q8C080 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Snx16Q8C080 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snx16Q8C080 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snx16Q8C080 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Snx16Q8C080 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Snx16Q8C080 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Snx16Q8C080 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Snx16Q8C080 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Snx16Q8C080 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx16Q8C080 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx16Q8C080 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Snx16Q8C080 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx16Q8C080 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx16Q8C080 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx16Q8C080 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx16Q8C080 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx16Q8C080 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Snx16Q8C080 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
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Snx16Q8C080 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Snx16Q8C080 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Snx16Q8C080 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Snx16Q8C080 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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