Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVA4

Lmod1, Leiomodin-1, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod1Q8BVA4 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Lmod1Q8BVA4 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lmod1Q8BVA4 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lmod1Q8BVA4 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lmod1Q8BVA4 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lmod1Q8BVA4 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lmod1Q8BVA4 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lmod1Q8BVA4 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lmod1Q8BVA4 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lmod1Q8BVA4 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Lmod1Q8BVA4 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Lmod1Q8BVA4 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Lmod1Q8BVA4 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lmod1Q8BVA4 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lmod1Q8BVA4 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Lmod1Q8BVA4 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Lmod1Q8BVA4 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lmod1Q8BVA4 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lmod1Q8BVA4 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lmod1Q8BVA4 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lmod1Q8BVA4 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lmod1Q8BVA4 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lmod1Q8BVA4 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lmod1Q8BVA4 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lmod1Q8BVA4 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Lmod1Q8BVA4 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lmod1Q8BVA4 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Lmod1Q8BVA4 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Lmod1Q8BVA4 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Lmod1Q8BVA4 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lmod1Q8BVA4 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lmod1Q8BVA4 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lmod1Q8BVA4 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lmod1Q8BVA4 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lmod1Q8BVA4 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lmod1Q8BVA4 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lmod1Q8BVA4 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lmod1Q8BVA4 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lmod1Q8BVA4 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lmod1Q8BVA4 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lmod1Q8BVA4 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lmod1Q8BVA4 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lmod1Q8BVA4 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lmod1Q8BVA4 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lmod1Q8BVA4 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lmod1Q8BVA4 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lmod1Q8BVA4 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lmod1Q8BVA4 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lmod1Q8BVA4 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lmod1Q8BVA4 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lmod1Q8BVA4 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lmod1Q8BVA4 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lmod1Q8BVA4 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lmod1Q8BVA4 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lmod1Q8BVA4 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lmod1Q8BVA4 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lmod1Q8BVA4 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lmod1Q8BVA4 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lmod1Q8BVA4 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lmod1Q8BVA4 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lmod1Q8BVA4 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lmod1Q8BVA4 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lmod1Q8BVA4 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lmod1Q8BVA4 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Lmod1Q8BVA4 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Lmod1Q8BVA4 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lmod1Q8BVA4 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lmod1Q8BVA4 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lmod1Q8BVA4 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lmod1Q8BVA4 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lmod1Q8BVA4 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lmod1Q8BVA4 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lmod1Q8BVA4 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lmod1Q8BVA4 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lmod1Q8BVA4 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lmod1Q8BVA4 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lmod1Q8BVA4 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lmod1Q8BVA4 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lmod1Q8BVA4 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lmod1Q8BVA4 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lmod1Q8BVA4 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lmod1Q8BVA4 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lmod1Q8BVA4 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lmod1Q8BVA4 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lmod1Q8BVA4 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lmod1Q8BVA4 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lmod1Q8BVA4 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lmod1Q8BVA4 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lmod1Q8BVA4 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lmod1Q8BVA4 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lmod1Q8BVA4 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lmod1Q8BVA4 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lmod1Q8BVA4 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lmod1Q8BVA4 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lmod1Q8BVA4 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lmod1Q8BVA4 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lmod1Q8BVA4 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lmod1Q8BVA4 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lmod1Q8BVA4 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lmod1Q8BVA4 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms