Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTS4

Nup54, Nuclear pore complex protein Nup54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup54Q8BTS4 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nup54Q8BTS4 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nup54Q8BTS4 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nup54Q8BTS4 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Nup54Q8BTS4 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nup54Q8BTS4 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nup54Q8BTS4 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nup54Q8BTS4 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nup54Q8BTS4 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nup54Q8BTS4 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nup54Q8BTS4 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Nup54Q8BTS4 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nup54Q8BTS4 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nup54Q8BTS4 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nup54Q8BTS4 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nup54Q8BTS4 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nup54Q8BTS4 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nup54Q8BTS4 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nup54Q8BTS4 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nup54Q8BTS4 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nup54Q8BTS4 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nup54Q8BTS4 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nup54Q8BTS4 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nup54Q8BTS4 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nup54Q8BTS4 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nup54Q8BTS4 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nup54Q8BTS4 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nup54Q8BTS4 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nup54Q8BTS4 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Nup54Q8BTS4 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nup54Q8BTS4 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nup54Q8BTS4 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nup54Q8BTS4 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nup54Q8BTS4 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nup54Q8BTS4 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nup54Q8BTS4 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nup54Q8BTS4 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nup54Q8BTS4 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nup54Q8BTS4 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nup54Q8BTS4 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nup54Q8BTS4 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nup54Q8BTS4 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nup54Q8BTS4 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nup54Q8BTS4 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nup54Q8BTS4 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Nup54Q8BTS4 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nup54Q8BTS4 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nup54Q8BTS4 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nup54Q8BTS4 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nup54Q8BTS4 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nup54Q8BTS4 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nup54Q8BTS4 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Nup54Q8BTS4 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nup54Q8BTS4 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nup54Q8BTS4 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nup54Q8BTS4 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nup54Q8BTS4 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nup54Q8BTS4 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nup54Q8BTS4 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nup54Q8BTS4 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nup54Q8BTS4 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nup54Q8BTS4 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nup54Q8BTS4 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nup54Q8BTS4 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nup54Q8BTS4 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nup54Q8BTS4 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nup54Q8BTS4 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nup54Q8BTS4 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nup54Q8BTS4 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nup54Q8BTS4 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nup54Q8BTS4 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nup54Q8BTS4 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nup54Q8BTS4 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nup54Q8BTS4 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nup54Q8BTS4 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nup54Q8BTS4 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nup54Q8BTS4 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nup54Q8BTS4 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nup54Q8BTS4 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Nup54Q8BTS4 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nup54Q8BTS4 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nup54Q8BTS4 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nup54Q8BTS4 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nup54Q8BTS4 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nup54Q8BTS4 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Nup54Q8BTS4 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nup54Q8BTS4 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nup54Q8BTS4 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nup54Q8BTS4 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Nup54Q8BTS4 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nup54Q8BTS4 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nup54Q8BTS4 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nup54Q8BTS4 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nup54Q8BTS4 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nup54Q8BTS4 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nup54Q8BTS4 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Nup54Q8BTS4 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nup54Q8BTS4 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nup54Q8BTS4 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nup54Q8BTS4 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms