Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMG7

Rab3gap2, Rab3 GTPase-activating protein non-catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3gap2Q8BMG7 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rab3gap2Q8BMG7 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rab3gap2Q8BMG7 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rab3gap2Q8BMG7 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rab3gap2Q8BMG7 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rab3gap2Q8BMG7 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rab3gap2Q8BMG7 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rab3gap2Q8BMG7 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rab3gap2Q8BMG7 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rab3gap2Q8BMG7 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rab3gap2Q8BMG7 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rab3gap2Q8BMG7 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rab3gap2Q8BMG7 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rab3gap2Q8BMG7 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Rab3gap2Q8BMG7 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Rab3gap2Q8BMG7 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rab3gap2Q8BMG7 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rab3gap2Q8BMG7 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rab3gap2Q8BMG7 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rab3gap2Q8BMG7 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rab3gap2Q8BMG7 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rab3gap2Q8BMG7 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rab3gap2Q8BMG7 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Rab3gap2Q8BMG7 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Rab3gap2Q8BMG7 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rab3gap2Q8BMG7 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rab3gap2Q8BMG7 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rab3gap2Q8BMG7 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rab3gap2Q8BMG7 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rab3gap2Q8BMG7 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rab3gap2Q8BMG7 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rab3gap2Q8BMG7 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rab3gap2Q8BMG7 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rab3gap2Q8BMG7 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rab3gap2Q8BMG7 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rab3gap2Q8BMG7 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rab3gap2Q8BMG7 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rab3gap2Q8BMG7 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rab3gap2Q8BMG7 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rab3gap2Q8BMG7 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rab3gap2Q8BMG7 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rab3gap2Q8BMG7 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rab3gap2Q8BMG7 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rab3gap2Q8BMG7 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rab3gap2Q8BMG7 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rab3gap2Q8BMG7 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rab3gap2Q8BMG7 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rab3gap2Q8BMG7 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rab3gap2Q8BMG7 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rab3gap2Q8BMG7 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rab3gap2Q8BMG7 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rab3gap2Q8BMG7 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Rab3gap2Q8BMG7 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rab3gap2Q8BMG7 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rab3gap2Q8BMG7 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rab3gap2Q8BMG7 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rab3gap2Q8BMG7 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rab3gap2Q8BMG7 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Rab3gap2Q8BMG7 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rab3gap2Q8BMG7 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rab3gap2Q8BMG7 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rab3gap2Q8BMG7 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rab3gap2Q8BMG7 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rab3gap2Q8BMG7 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rab3gap2Q8BMG7 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rab3gap2Q8BMG7 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rab3gap2Q8BMG7 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rab3gap2Q8BMG7 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rab3gap2Q8BMG7 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rab3gap2Q8BMG7 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rab3gap2Q8BMG7 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rab3gap2Q8BMG7 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rab3gap2Q8BMG7 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rab3gap2Q8BMG7 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rab3gap2Q8BMG7 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rab3gap2Q8BMG7 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rab3gap2Q8BMG7 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rab3gap2Q8BMG7 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rab3gap2Q8BMG7 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rab3gap2Q8BMG7 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rab3gap2Q8BMG7 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Rab3gap2Q8BMG7 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rab3gap2Q8BMG7 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rab3gap2Q8BMG7 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rab3gap2Q8BMG7 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rab3gap2Q8BMG7 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rab3gap2Q8BMG7 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rab3gap2Q8BMG7 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rab3gap2Q8BMG7 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rab3gap2Q8BMG7 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rab3gap2Q8BMG7 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rab3gap2Q8BMG7 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rab3gap2Q8BMG7 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rab3gap2Q8BMG7 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rab3gap2Q8BMG7 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rab3gap2Q8BMG7 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Rab3gap2Q8BMG7 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Rab3gap2Q8BMG7 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rab3gap2Q8BMG7 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rab3gap2Q8BMG7 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms