Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp54Q8BL06 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Usp54Q8BL06 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Usp54Q8BL06 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Usp54Q8BL06 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Usp54Q8BL06 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Usp54Q8BL06 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Usp54Q8BL06 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Usp54Q8BL06 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Usp54Q8BL06 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Usp54Q8BL06 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Usp54Q8BL06 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Usp54Q8BL06 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp54Q8BL06 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp54Q8BL06 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp54Q8BL06 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp54Q8BL06 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp54Q8BL06 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp54Q8BL06 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp54Q8BL06 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp54Q8BL06 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp54Q8BL06 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp54Q8BL06 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp54Q8BL06 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp54Q8BL06 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Usp54Q8BL06 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Usp54Q8BL06 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Usp54Q8BL06 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Usp54Q8BL06 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Usp54Q8BL06 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Usp54Q8BL06 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Usp54Q8BL06 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Usp54Q8BL06 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Usp54Q8BL06 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Usp54Q8BL06 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Usp54Q8BL06 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Usp54Q8BL06 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp54Q8BL06 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp54Q8BL06 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp54Q8BL06 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp54Q8BL06 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp54Q8BL06 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp54Q8BL06 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp54Q8BL06 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp54Q8BL06 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Usp54Q8BL06 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Usp54Q8BL06 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Usp54Q8BL06 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Usp54Q8BL06 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Usp54Q8BL06 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Usp54Q8BL06 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Usp54Q8BL06 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Usp54Q8BL06 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Usp54Q8BL06 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Usp54Q8BL06 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Usp54Q8BL06 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Usp54Q8BL06 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Usp54Q8BL06 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Usp54Q8BL06 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Usp54Q8BL06 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Usp54Q8BL06 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Usp54Q8BL06 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Usp54Q8BL06 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Usp54Q8BL06 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Usp54Q8BL06 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Usp54Q8BL06 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Usp54Q8BL06 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Usp54Q8BL06 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Usp54Q8BL06 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp54Q8BL06 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp54Q8BL06 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp54Q8BL06 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp54Q8BL06 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp54Q8BL06 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp54Q8BL06 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp54Q8BL06 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp54Q8BL06 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp54Q8BL06 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp54Q8BL06 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp54Q8BL06 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp54Q8BL06 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Usp54Q8BL06 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Usp54Q8BL06 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Usp54Q8BL06 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Usp54Q8BL06 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Usp54Q8BL06 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Usp54Q8BL06 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Usp54Q8BL06 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Usp54Q8BL06 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Usp54Q8BL06 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Usp54Q8BL06 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Usp54Q8BL06 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Usp54Q8BL06 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Usp54Q8BL06 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Usp54Q8BL06 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Usp54Q8BL06 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Usp54Q8BL06 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp54Q8BL06 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp54Q8BL06 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp54Q8BL06 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms