Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG39

Sv2b, Synaptic vesicle glycoprotein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sv2bQ8BG39 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sv2bQ8BG39 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sv2bQ8BG39 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sv2bQ8BG39 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sv2bQ8BG39 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Sv2bQ8BG39 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sv2bQ8BG39 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sv2bQ8BG39 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sv2bQ8BG39 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sv2bQ8BG39 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sv2bQ8BG39 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sv2bQ8BG39 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sv2bQ8BG39 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sv2bQ8BG39 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sv2bQ8BG39 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sv2bQ8BG39 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sv2bQ8BG39 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sv2bQ8BG39 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sv2bQ8BG39 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sv2bQ8BG39 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sv2bQ8BG39 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sv2bQ8BG39 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sv2bQ8BG39 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sv2bQ8BG39 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sv2bQ8BG39 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sv2bQ8BG39 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sv2bQ8BG39 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sv2bQ8BG39 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Sv2bQ8BG39 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Sv2bQ8BG39 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sv2bQ8BG39 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sv2bQ8BG39 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sv2bQ8BG39 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sv2bQ8BG39 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sv2bQ8BG39 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sv2bQ8BG39 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sv2bQ8BG39 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sv2bQ8BG39 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sv2bQ8BG39 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Sv2bQ8BG39 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sv2bQ8BG39 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sv2bQ8BG39 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sv2bQ8BG39 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sv2bQ8BG39 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Sv2bQ8BG39 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sv2bQ8BG39 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sv2bQ8BG39 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sv2bQ8BG39 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sv2bQ8BG39 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sv2bQ8BG39 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sv2bQ8BG39 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sv2bQ8BG39 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sv2bQ8BG39 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sv2bQ8BG39 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sv2bQ8BG39 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sv2bQ8BG39 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sv2bQ8BG39 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sv2bQ8BG39 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sv2bQ8BG39 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sv2bQ8BG39 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sv2bQ8BG39 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Sv2bQ8BG39 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Sv2bQ8BG39 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Sv2bQ8BG39 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sv2bQ8BG39 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sv2bQ8BG39 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sv2bQ8BG39 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sv2bQ8BG39 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sv2bQ8BG39 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sv2bQ8BG39 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sv2bQ8BG39 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sv2bQ8BG39 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sv2bQ8BG39 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sv2bQ8BG39 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sv2bQ8BG39 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sv2bQ8BG39 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sv2bQ8BG39 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Sv2bQ8BG39 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sv2bQ8BG39 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sv2bQ8BG39 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sv2bQ8BG39 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sv2bQ8BG39 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sv2bQ8BG39 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sv2bQ8BG39 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Sv2bQ8BG39 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sv2bQ8BG39 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sv2bQ8BG39 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sv2bQ8BG39 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sv2bQ8BG39 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sv2bQ8BG39 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sv2bQ8BG39 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sv2bQ8BG39 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sv2bQ8BG39 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sv2bQ8BG39 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sv2bQ8BG39 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Sv2bQ8BG39 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sv2bQ8BG39 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sv2bQ8BG39 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sv2bQ8BG39 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sv2bQ8BG39 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms