Protein–RNA interactions for Protein: Q811C2

Atg4c, Cysteine protease ATG4C, mousemouse

Predictions only

Length 458 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4cQ811C2 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atg4cQ811C2 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atg4cQ811C2 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atg4cQ811C2 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atg4cQ811C2 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atg4cQ811C2 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atg4cQ811C2 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atg4cQ811C2 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atg4cQ811C2 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atg4cQ811C2 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atg4cQ811C2 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atg4cQ811C2 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atg4cQ811C2 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atg4cQ811C2 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Atg4cQ811C2 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Atg4cQ811C2 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atg4cQ811C2 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atg4cQ811C2 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Atg4cQ811C2 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atg4cQ811C2 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atg4cQ811C2 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atg4cQ811C2 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Atg4cQ811C2 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atg4cQ811C2 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atg4cQ811C2 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Atg4cQ811C2 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Atg4cQ811C2 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Atg4cQ811C2 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Atg4cQ811C2 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Atg4cQ811C2 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Atg4cQ811C2 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Atg4cQ811C2 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Atg4cQ811C2 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atg4cQ811C2 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Atg4cQ811C2 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atg4cQ811C2 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atg4cQ811C2 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atg4cQ811C2 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atg4cQ811C2 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atg4cQ811C2 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atg4cQ811C2 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atg4cQ811C2 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atg4cQ811C2 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atg4cQ811C2 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atg4cQ811C2 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atg4cQ811C2 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atg4cQ811C2 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atg4cQ811C2 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atg4cQ811C2 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atg4cQ811C2 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atg4cQ811C2 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atg4cQ811C2 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atg4cQ811C2 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Atg4cQ811C2 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atg4cQ811C2 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atg4cQ811C2 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atg4cQ811C2 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atg4cQ811C2 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atg4cQ811C2 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atg4cQ811C2 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atg4cQ811C2 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atg4cQ811C2 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atg4cQ811C2 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atg4cQ811C2 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atg4cQ811C2 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atg4cQ811C2 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atg4cQ811C2 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atg4cQ811C2 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atg4cQ811C2 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atg4cQ811C2 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atg4cQ811C2 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atg4cQ811C2 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atg4cQ811C2 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atg4cQ811C2 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Atg4cQ811C2 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atg4cQ811C2 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atg4cQ811C2 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atg4cQ811C2 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atg4cQ811C2 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atg4cQ811C2 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atg4cQ811C2 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atg4cQ811C2 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atg4cQ811C2 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atg4cQ811C2 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atg4cQ811C2 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atg4cQ811C2 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atg4cQ811C2 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atg4cQ811C2 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atg4cQ811C2 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atg4cQ811C2 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Atg4cQ811C2 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atg4cQ811C2 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atg4cQ811C2 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atg4cQ811C2 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atg4cQ811C2 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atg4cQ811C2 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atg4cQ811C2 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atg4cQ811C2 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atg4cQ811C2 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atg4cQ811C2 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms