Protein–RNA interactions for Protein: Q810N9

Ccdc172, Coiled-coil domain-containing protein 172, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc172Q810N9 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc172Q810N9 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc172Q810N9 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc172Q810N9 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc172Q810N9 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc172Q810N9 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc172Q810N9 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc172Q810N9 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc172Q810N9 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc172Q810N9 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc172Q810N9 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc172Q810N9 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc172Q810N9 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc172Q810N9 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc172Q810N9 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc172Q810N9 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc172Q810N9 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc172Q810N9 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc172Q810N9 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc172Q810N9 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc172Q810N9 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc172Q810N9 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc172Q810N9 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc172Q810N9 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc172Q810N9 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc172Q810N9 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc172Q810N9 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc172Q810N9 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc172Q810N9 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ccdc172Q810N9 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc172Q810N9 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc172Q810N9 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc172Q810N9 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc172Q810N9 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc172Q810N9 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc172Q810N9 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc172Q810N9 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc172Q810N9 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc172Q810N9 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc172Q810N9 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc172Q810N9 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc172Q810N9 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc172Q810N9 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc172Q810N9 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc172Q810N9 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc172Q810N9 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc172Q810N9 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc172Q810N9 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc172Q810N9 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc172Q810N9 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc172Q810N9 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc172Q810N9 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc172Q810N9 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc172Q810N9 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc172Q810N9 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc172Q810N9 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc172Q810N9 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc172Q810N9 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc172Q810N9 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc172Q810N9 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc172Q810N9 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc172Q810N9 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc172Q810N9 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc172Q810N9 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc172Q810N9 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc172Q810N9 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc172Q810N9 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc172Q810N9 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc172Q810N9 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc172Q810N9 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc172Q810N9 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc172Q810N9 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc172Q810N9 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc172Q810N9 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc172Q810N9 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc172Q810N9 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc172Q810N9 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc172Q810N9 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc172Q810N9 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc172Q810N9 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc172Q810N9 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc172Q810N9 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc172Q810N9 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc172Q810N9 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc172Q810N9 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc172Q810N9 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc172Q810N9 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc172Q810N9 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc172Q810N9 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc172Q810N9 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc172Q810N9 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc172Q810N9 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc172Q810N9 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc172Q810N9 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc172Q810N9 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc172Q810N9 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc172Q810N9 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc172Q810N9 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc172Q810N9 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc172Q810N9 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms