Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZS5

Cldn34b3, Claudin 34B3, mousemouse

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Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b3Q80ZS5 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn34b3Q80ZS5 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cldn34b3Q80ZS5 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cldn34b3Q80ZS5 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cldn34b3Q80ZS5 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn34b3Q80ZS5 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn34b3Q80ZS5 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn34b3Q80ZS5 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn34b3Q80ZS5 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn34b3Q80ZS5 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn34b3Q80ZS5 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn34b3Q80ZS5 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn34b3Q80ZS5 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn34b3Q80ZS5 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Cldn34b3Q80ZS5 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn34b3Q80ZS5 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Cldn34b3Q80ZS5 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn34b3Q80ZS5 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn34b3Q80ZS5 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn34b3Q80ZS5 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn34b3Q80ZS5 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn34b3Q80ZS5 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn34b3Q80ZS5 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn34b3Q80ZS5 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn34b3Q80ZS5 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Cldn34b3Q80ZS5 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
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Cldn34b3Q80ZS5 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn34b3Q80ZS5 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Cldn34b3Q80ZS5 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn34b3Q80ZS5 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn34b3Q80ZS5 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn34b3Q80ZS5 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn34b3Q80ZS5 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn34b3Q80ZS5 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn34b3Q80ZS5 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn34b3Q80ZS5 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn34b3Q80ZS5 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn34b3Q80ZS5 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn34b3Q80ZS5 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn34b3Q80ZS5 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn34b3Q80ZS5 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn34b3Q80ZS5 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn34b3Q80ZS5 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn34b3Q80ZS5 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn34b3Q80ZS5 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn34b3Q80ZS5 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Cldn34b3Q80ZS5 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn34b3Q80ZS5 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn34b3Q80ZS5 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn34b3Q80ZS5 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn34b3Q80ZS5 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Cldn34b3Q80ZS5 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn34b3Q80ZS5 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn34b3Q80ZS5 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn34b3Q80ZS5 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn34b3Q80ZS5 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn34b3Q80ZS5 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn34b3Q80ZS5 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn34b3Q80ZS5 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn34b3Q80ZS5 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn34b3Q80ZS5 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn34b3Q80ZS5 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn34b3Q80ZS5 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn34b3Q80ZS5 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn34b3Q80ZS5 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn34b3Q80ZS5 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn34b3Q80ZS5 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn34b3Q80ZS5 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn34b3Q80ZS5 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn34b3Q80ZS5 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn34b3Q80ZS5 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn34b3Q80ZS5 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn34b3Q80ZS5 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn34b3Q80ZS5 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn34b3Q80ZS5 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn34b3Q80ZS5 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn34b3Q80ZS5 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn34b3Q80ZS5 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn34b3Q80ZS5 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn34b3Q80ZS5 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn34b3Q80ZS5 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn34b3Q80ZS5 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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