Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z24

Negr1, Neuronal growth regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Negr1Q80Z24 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Negr1Q80Z24 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Negr1Q80Z24 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Negr1Q80Z24 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Negr1Q80Z24 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Negr1Q80Z24 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Negr1Q80Z24 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Negr1Q80Z24 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Negr1Q80Z24 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Negr1Q80Z24 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Negr1Q80Z24 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Negr1Q80Z24 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Negr1Q80Z24 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Negr1Q80Z24 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Negr1Q80Z24 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Negr1Q80Z24 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Negr1Q80Z24 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Negr1Q80Z24 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Negr1Q80Z24 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Negr1Q80Z24 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Negr1Q80Z24 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Negr1Q80Z24 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Negr1Q80Z24 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Negr1Q80Z24 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Negr1Q80Z24 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Negr1Q80Z24 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Negr1Q80Z24 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Negr1Q80Z24 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Negr1Q80Z24 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Negr1Q80Z24 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Negr1Q80Z24 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Negr1Q80Z24 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Negr1Q80Z24 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Negr1Q80Z24 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Negr1Q80Z24 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Negr1Q80Z24 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Negr1Q80Z24 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Negr1Q80Z24 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Negr1Q80Z24 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Negr1Q80Z24 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Negr1Q80Z24 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Negr1Q80Z24 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Negr1Q80Z24 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Negr1Q80Z24 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Negr1Q80Z24 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Negr1Q80Z24 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Negr1Q80Z24 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Negr1Q80Z24 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Negr1Q80Z24 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Negr1Q80Z24 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Negr1Q80Z24 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Negr1Q80Z24 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Negr1Q80Z24 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Negr1Q80Z24 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Negr1Q80Z24 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Negr1Q80Z24 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Negr1Q80Z24 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Negr1Q80Z24 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Negr1Q80Z24 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Negr1Q80Z24 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Negr1Q80Z24 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Negr1Q80Z24 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Negr1Q80Z24 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Negr1Q80Z24 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Negr1Q80Z24 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Negr1Q80Z24 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Negr1Q80Z24 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Negr1Q80Z24 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Negr1Q80Z24 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Negr1Q80Z24 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Negr1Q80Z24 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Negr1Q80Z24 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Negr1Q80Z24 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Negr1Q80Z24 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Negr1Q80Z24 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Negr1Q80Z24 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Negr1Q80Z24 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Negr1Q80Z24 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Negr1Q80Z24 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Negr1Q80Z24 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Negr1Q80Z24 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Negr1Q80Z24 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Negr1Q80Z24 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Negr1Q80Z24 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Negr1Q80Z24 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Negr1Q80Z24 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Negr1Q80Z24 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Negr1Q80Z24 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Negr1Q80Z24 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Negr1Q80Z24 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Negr1Q80Z24 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Negr1Q80Z24 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Negr1Q80Z24 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Negr1Q80Z24 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Negr1Q80Z24 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Negr1Q80Z24 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Negr1Q80Z24 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Negr1Q80Z24 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Negr1Q80Z24 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Negr1Q80Z24 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms