Protein–RNA interactions for Protein: Q80VQ0

Aldh3b1, Aldehyde dehydrogenase family 3 member B1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh3b1Q80VQ0 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Aldh3b1Q80VQ0 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Aldh3b1Q80VQ0 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Aldh3b1Q80VQ0 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Aldh3b1Q80VQ0 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Aldh3b1Q80VQ0 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Aldh3b1Q80VQ0 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Aldh3b1Q80VQ0 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Aldh3b1Q80VQ0 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Aldh3b1Q80VQ0 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Aldh3b1Q80VQ0 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Aldh3b1Q80VQ0 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Aldh3b1Q80VQ0 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Aldh3b1Q80VQ0 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Aldh3b1Q80VQ0 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Aldh3b1Q80VQ0 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Aldh3b1Q80VQ0 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Aldh3b1Q80VQ0 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Aldh3b1Q80VQ0 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Aldh3b1Q80VQ0 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Aldh3b1Q80VQ0 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Aldh3b1Q80VQ0 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Aldh3b1Q80VQ0 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Aldh3b1Q80VQ0 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Aldh3b1Q80VQ0 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Aldh3b1Q80VQ0 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Aldh3b1Q80VQ0 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Aldh3b1Q80VQ0 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Aldh3b1Q80VQ0 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Aldh3b1Q80VQ0 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Aldh3b1Q80VQ0 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Aldh3b1Q80VQ0 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Aldh3b1Q80VQ0 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Aldh3b1Q80VQ0 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Aldh3b1Q80VQ0 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Aldh3b1Q80VQ0 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Aldh3b1Q80VQ0 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Aldh3b1Q80VQ0 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Aldh3b1Q80VQ0 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Aldh3b1Q80VQ0 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Aldh3b1Q80VQ0 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Aldh3b1Q80VQ0 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Aldh3b1Q80VQ0 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Aldh3b1Q80VQ0 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Aldh3b1Q80VQ0 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Aldh3b1Q80VQ0 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Aldh3b1Q80VQ0 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Aldh3b1Q80VQ0 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Aldh3b1Q80VQ0 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Aldh3b1Q80VQ0 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Aldh3b1Q80VQ0 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Aldh3b1Q80VQ0 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Aldh3b1Q80VQ0 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Aldh3b1Q80VQ0 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Aldh3b1Q80VQ0 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Aldh3b1Q80VQ0 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Aldh3b1Q80VQ0 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Aldh3b1Q80VQ0 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Aldh3b1Q80VQ0 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Aldh3b1Q80VQ0 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Aldh3b1Q80VQ0 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Aldh3b1Q80VQ0 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Aldh3b1Q80VQ0 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Aldh3b1Q80VQ0 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Aldh3b1Q80VQ0 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Aldh3b1Q80VQ0 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Aldh3b1Q80VQ0 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Aldh3b1Q80VQ0 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Aldh3b1Q80VQ0 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Aldh3b1Q80VQ0 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Aldh3b1Q80VQ0 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Aldh3b1Q80VQ0 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Aldh3b1Q80VQ0 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Aldh3b1Q80VQ0 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Aldh3b1Q80VQ0 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Aldh3b1Q80VQ0 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aldh3b1Q80VQ0 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aldh3b1Q80VQ0 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aldh3b1Q80VQ0 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aldh3b1Q80VQ0 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aldh3b1Q80VQ0 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aldh3b1Q80VQ0 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aldh3b1Q80VQ0 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aldh3b1Q80VQ0 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aldh3b1Q80VQ0 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aldh3b1Q80VQ0 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aldh3b1Q80VQ0 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aldh3b1Q80VQ0 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aldh3b1Q80VQ0 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aldh3b1Q80VQ0 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Aldh3b1Q80VQ0 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aldh3b1Q80VQ0 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Aldh3b1Q80VQ0 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Aldh3b1Q80VQ0 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Aldh3b1Q80VQ0 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aldh3b1Q80VQ0 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aldh3b1Q80VQ0 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aldh3b1Q80VQ0 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aldh3b1Q80VQ0 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Aldh3b1Q80VQ0 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms