Protein–RNA interactions for Protein: Q80UK0

Sestd1, SEC14 domain and spectrin repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 696 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sestd1Q80UK0 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sestd1Q80UK0 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sestd1Q80UK0 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sestd1Q80UK0 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sestd1Q80UK0 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sestd1Q80UK0 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sestd1Q80UK0 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sestd1Q80UK0 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sestd1Q80UK0 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sestd1Q80UK0 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sestd1Q80UK0 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sestd1Q80UK0 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Sestd1Q80UK0 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sestd1Q80UK0 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sestd1Q80UK0 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sestd1Q80UK0 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sestd1Q80UK0 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sestd1Q80UK0 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sestd1Q80UK0 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sestd1Q80UK0 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sestd1Q80UK0 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sestd1Q80UK0 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sestd1Q80UK0 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sestd1Q80UK0 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sestd1Q80UK0 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sestd1Q80UK0 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sestd1Q80UK0 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sestd1Q80UK0 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sestd1Q80UK0 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Sestd1Q80UK0 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sestd1Q80UK0 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sestd1Q80UK0 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sestd1Q80UK0 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sestd1Q80UK0 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sestd1Q80UK0 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sestd1Q80UK0 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sestd1Q80UK0 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sestd1Q80UK0 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sestd1Q80UK0 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sestd1Q80UK0 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sestd1Q80UK0 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sestd1Q80UK0 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sestd1Q80UK0 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sestd1Q80UK0 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sestd1Q80UK0 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sestd1Q80UK0 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sestd1Q80UK0 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sestd1Q80UK0 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sestd1Q80UK0 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sestd1Q80UK0 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sestd1Q80UK0 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sestd1Q80UK0 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sestd1Q80UK0 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sestd1Q80UK0 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sestd1Q80UK0 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sestd1Q80UK0 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sestd1Q80UK0 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Sestd1Q80UK0 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sestd1Q80UK0 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sestd1Q80UK0 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sestd1Q80UK0 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sestd1Q80UK0 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sestd1Q80UK0 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sestd1Q80UK0 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sestd1Q80UK0 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sestd1Q80UK0 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sestd1Q80UK0 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sestd1Q80UK0 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sestd1Q80UK0 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sestd1Q80UK0 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sestd1Q80UK0 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sestd1Q80UK0 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sestd1Q80UK0 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sestd1Q80UK0 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sestd1Q80UK0 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sestd1Q80UK0 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sestd1Q80UK0 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sestd1Q80UK0 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sestd1Q80UK0 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sestd1Q80UK0 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sestd1Q80UK0 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sestd1Q80UK0 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sestd1Q80UK0 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sestd1Q80UK0 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sestd1Q80UK0 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sestd1Q80UK0 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sestd1Q80UK0 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Sestd1Q80UK0 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Sestd1Q80UK0 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sestd1Q80UK0 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sestd1Q80UK0 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sestd1Q80UK0 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sestd1Q80UK0 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sestd1Q80UK0 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sestd1Q80UK0 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sestd1Q80UK0 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sestd1Q80UK0 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sestd1Q80UK0 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sestd1Q80UK0 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sestd1Q80UK0 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms