Protein–RNA interactions for Protein: Q80U56

Avl9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Avl9Q80U56 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Avl9Q80U56 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Avl9Q80U56 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Avl9Q80U56 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Avl9Q80U56 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Avl9Q80U56 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Avl9Q80U56 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Avl9Q80U56 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Avl9Q80U56 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Avl9Q80U56 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Avl9Q80U56 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Avl9Q80U56 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Avl9Q80U56 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Avl9Q80U56 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Avl9Q80U56 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Avl9Q80U56 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Avl9Q80U56 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Avl9Q80U56 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Avl9Q80U56 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Avl9Q80U56 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Avl9Q80U56 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Avl9Q80U56 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Avl9Q80U56 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Avl9Q80U56 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Avl9Q80U56 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Avl9Q80U56 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Avl9Q80U56 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Avl9Q80U56 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Avl9Q80U56 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Avl9Q80U56 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Avl9Q80U56 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Avl9Q80U56 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Avl9Q80U56 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Avl9Q80U56 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Avl9Q80U56 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Avl9Q80U56 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Avl9Q80U56 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Avl9Q80U56 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Avl9Q80U56 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Avl9Q80U56 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Avl9Q80U56 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Avl9Q80U56 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Avl9Q80U56 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Avl9Q80U56 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Avl9Q80U56 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Avl9Q80U56 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Avl9Q80U56 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Avl9Q80U56 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Avl9Q80U56 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Avl9Q80U56 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Avl9Q80U56 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Avl9Q80U56 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Avl9Q80U56 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Avl9Q80U56 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Avl9Q80U56 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Avl9Q80U56 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Avl9Q80U56 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Avl9Q80U56 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Avl9Q80U56 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Avl9Q80U56 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Avl9Q80U56 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Avl9Q80U56 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Avl9Q80U56 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Avl9Q80U56 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Avl9Q80U56 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Avl9Q80U56 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Avl9Q80U56 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Avl9Q80U56 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Avl9Q80U56 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Avl9Q80U56 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Avl9Q80U56 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Avl9Q80U56 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Avl9Q80U56 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Avl9Q80U56 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Avl9Q80U56 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Avl9Q80U56 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Avl9Q80U56 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Avl9Q80U56 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Avl9Q80U56 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Avl9Q80U56 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Avl9Q80U56 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Avl9Q80U56 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Avl9Q80U56 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Avl9Q80U56 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Avl9Q80U56 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Avl9Q80U56 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Avl9Q80U56 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Avl9Q80U56 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Avl9Q80U56 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Avl9Q80U56 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Avl9Q80U56 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Avl9Q80U56 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Avl9Q80U56 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Avl9Q80U56 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Avl9Q80U56 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Avl9Q80U56 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Avl9Q80U56 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Avl9Q80U56 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Avl9Q80U56 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Avl9Q80U56 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms