Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
NischQ80TM9 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
NischQ80TM9 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
NischQ80TM9 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
NischQ80TM9 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
NischQ80TM9 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
NischQ80TM9 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
NischQ80TM9 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
NischQ80TM9 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
NischQ80TM9 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC35.85■■■■□ 3.33
NischQ80TM9 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
NischQ80TM9 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
NischQ80TM9 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
NischQ80TM9 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
NischQ80TM9 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC35.84■■■■□ 3.33
NischQ80TM9 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
NischQ80TM9 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC35.84■■■■□ 3.33
NischQ80TM9 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
NischQ80TM9 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
NischQ80TM9 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
NischQ80TM9 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
NischQ80TM9 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
NischQ80TM9 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
NischQ80TM9 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
NischQ80TM9 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
NischQ80TM9 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
NischQ80TM9 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
NischQ80TM9 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
NischQ80TM9 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
NischQ80TM9 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
NischQ80TM9 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
NischQ80TM9 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
NischQ80TM9 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
NischQ80TM9 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
NischQ80TM9 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
NischQ80TM9 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
NischQ80TM9 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
NischQ80TM9 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
NischQ80TM9 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
NischQ80TM9 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
NischQ80TM9 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
NischQ80TM9 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.81■■■■□ 3.32
NischQ80TM9 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC35.81■■■■□ 3.32
NischQ80TM9 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC35.81■■■■□ 3.32
NischQ80TM9 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
NischQ80TM9 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
NischQ80TM9 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
NischQ80TM9 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
NischQ80TM9 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
NischQ80TM9 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
NischQ80TM9 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.8■■■■□ 3.32
NischQ80TM9 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
NischQ80TM9 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC35.8■■■■□ 3.32
NischQ80TM9 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
NischQ80TM9 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
NischQ80TM9 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC35.8■■■■□ 3.32
NischQ80TM9 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
NischQ80TM9 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
NischQ80TM9 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC35.79■■■■□ 3.32
NischQ80TM9 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
NischQ80TM9 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC35.79■■■■□ 3.32
NischQ80TM9 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
NischQ80TM9 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
NischQ80TM9 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
NischQ80TM9 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
NischQ80TM9 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
NischQ80TM9 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
NischQ80TM9 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
NischQ80TM9 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
NischQ80TM9 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
NischQ80TM9 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
NischQ80TM9 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
NischQ80TM9 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
NischQ80TM9 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
NischQ80TM9 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
NischQ80TM9 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
NischQ80TM9 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
NischQ80TM9 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
NischQ80TM9 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
NischQ80TM9 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.32
NischQ80TM9 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
NischQ80TM9 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.31
NischQ80TM9 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
NischQ80TM9 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
NischQ80TM9 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
NischQ80TM9 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
NischQ80TM9 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC35.75■■■■□ 3.31
NischQ80TM9 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
NischQ80TM9 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC35.75■■■■□ 3.31
NischQ80TM9 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC35.75■■■■□ 3.31
NischQ80TM9 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
NischQ80TM9 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
NischQ80TM9 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
NischQ80TM9 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
NischQ80TM9 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
NischQ80TM9 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
NischQ80TM9 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC35.74■■■■□ 3.31
NischQ80TM9 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
NischQ80TM9 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
NischQ80TM9 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
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