Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSQ1

Clec18a, C-type lectin domain family 18 member A, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec18aQ7TSQ1 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clec18aQ7TSQ1 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clec18aQ7TSQ1 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clec18aQ7TSQ1 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clec18aQ7TSQ1 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clec18aQ7TSQ1 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Clec18aQ7TSQ1 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clec18aQ7TSQ1 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clec18aQ7TSQ1 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clec18aQ7TSQ1 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clec18aQ7TSQ1 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clec18aQ7TSQ1 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clec18aQ7TSQ1 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clec18aQ7TSQ1 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clec18aQ7TSQ1 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clec18aQ7TSQ1 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clec18aQ7TSQ1 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clec18aQ7TSQ1 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clec18aQ7TSQ1 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Clec18aQ7TSQ1 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clec18aQ7TSQ1 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clec18aQ7TSQ1 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clec18aQ7TSQ1 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clec18aQ7TSQ1 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clec18aQ7TSQ1 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clec18aQ7TSQ1 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clec18aQ7TSQ1 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clec18aQ7TSQ1 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clec18aQ7TSQ1 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clec18aQ7TSQ1 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clec18aQ7TSQ1 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clec18aQ7TSQ1 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clec18aQ7TSQ1 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clec18aQ7TSQ1 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clec18aQ7TSQ1 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clec18aQ7TSQ1 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clec18aQ7TSQ1 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clec18aQ7TSQ1 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Clec18aQ7TSQ1 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clec18aQ7TSQ1 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clec18aQ7TSQ1 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clec18aQ7TSQ1 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clec18aQ7TSQ1 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Clec18aQ7TSQ1 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Clec18aQ7TSQ1 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Clec18aQ7TSQ1 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Clec18aQ7TSQ1 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Clec18aQ7TSQ1 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Clec18aQ7TSQ1 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Clec18aQ7TSQ1 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Clec18aQ7TSQ1 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Clec18aQ7TSQ1 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Clec18aQ7TSQ1 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Clec18aQ7TSQ1 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Clec18aQ7TSQ1 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Clec18aQ7TSQ1 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Clec18aQ7TSQ1 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Clec18aQ7TSQ1 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clec18aQ7TSQ1 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clec18aQ7TSQ1 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clec18aQ7TSQ1 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clec18aQ7TSQ1 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clec18aQ7TSQ1 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clec18aQ7TSQ1 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clec18aQ7TSQ1 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clec18aQ7TSQ1 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clec18aQ7TSQ1 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clec18aQ7TSQ1 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
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Clec18aQ7TSQ1 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clec18aQ7TSQ1 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Clec18aQ7TSQ1 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clec18aQ7TSQ1 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clec18aQ7TSQ1 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clec18aQ7TSQ1 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clec18aQ7TSQ1 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clec18aQ7TSQ1 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clec18aQ7TSQ1 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clec18aQ7TSQ1 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clec18aQ7TSQ1 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clec18aQ7TSQ1 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clec18aQ7TSQ1 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clec18aQ7TSQ1 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Clec18aQ7TSQ1 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Clec18aQ7TSQ1 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Clec18aQ7TSQ1 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Clec18aQ7TSQ1 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Clec18aQ7TSQ1 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Clec18aQ7TSQ1 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Clec18aQ7TSQ1 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Clec18aQ7TSQ1 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Clec18aQ7TSQ1 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Clec18aQ7TSQ1 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Clec18aQ7TSQ1 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Clec18aQ7TSQ1 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Clec18aQ7TSQ1 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Clec18aQ7TSQ1 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Clec18aQ7TSQ1 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Clec18aQ7TSQ1 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Clec18aQ7TSQ1 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms