Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS58

Clec4b1, Antigen presenting cell lectin-like receptor A2, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec4b1Q7TS58 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clec4b1Q7TS58 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clec4b1Q7TS58 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clec4b1Q7TS58 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clec4b1Q7TS58 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clec4b1Q7TS58 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clec4b1Q7TS58 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Clec4b1Q7TS58 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clec4b1Q7TS58 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clec4b1Q7TS58 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clec4b1Q7TS58 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clec4b1Q7TS58 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clec4b1Q7TS58 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clec4b1Q7TS58 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clec4b1Q7TS58 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clec4b1Q7TS58 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clec4b1Q7TS58 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clec4b1Q7TS58 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clec4b1Q7TS58 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clec4b1Q7TS58 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clec4b1Q7TS58 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clec4b1Q7TS58 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clec4b1Q7TS58 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clec4b1Q7TS58 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clec4b1Q7TS58 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clec4b1Q7TS58 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clec4b1Q7TS58 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clec4b1Q7TS58 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clec4b1Q7TS58 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clec4b1Q7TS58 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clec4b1Q7TS58 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clec4b1Q7TS58 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clec4b1Q7TS58 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clec4b1Q7TS58 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clec4b1Q7TS58 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clec4b1Q7TS58 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clec4b1Q7TS58 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clec4b1Q7TS58 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clec4b1Q7TS58 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clec4b1Q7TS58 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clec4b1Q7TS58 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clec4b1Q7TS58 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clec4b1Q7TS58 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clec4b1Q7TS58 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clec4b1Q7TS58 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clec4b1Q7TS58 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clec4b1Q7TS58 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clec4b1Q7TS58 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clec4b1Q7TS58 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clec4b1Q7TS58 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clec4b1Q7TS58 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clec4b1Q7TS58 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clec4b1Q7TS58 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clec4b1Q7TS58 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clec4b1Q7TS58 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Clec4b1Q7TS58 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clec4b1Q7TS58 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clec4b1Q7TS58 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clec4b1Q7TS58 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clec4b1Q7TS58 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clec4b1Q7TS58 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clec4b1Q7TS58 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clec4b1Q7TS58 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clec4b1Q7TS58 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clec4b1Q7TS58 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clec4b1Q7TS58 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clec4b1Q7TS58 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clec4b1Q7TS58 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clec4b1Q7TS58 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clec4b1Q7TS58 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clec4b1Q7TS58 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clec4b1Q7TS58 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clec4b1Q7TS58 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clec4b1Q7TS58 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clec4b1Q7TS58 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clec4b1Q7TS58 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clec4b1Q7TS58 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clec4b1Q7TS58 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clec4b1Q7TS58 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clec4b1Q7TS58 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clec4b1Q7TS58 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clec4b1Q7TS58 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clec4b1Q7TS58 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clec4b1Q7TS58 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clec4b1Q7TS58 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clec4b1Q7TS58 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Clec4b1Q7TS58 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Clec4b1Q7TS58 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clec4b1Q7TS58 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clec4b1Q7TS58 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clec4b1Q7TS58 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Clec4b1Q7TS58 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clec4b1Q7TS58 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clec4b1Q7TS58 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clec4b1Q7TS58 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clec4b1Q7TS58 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clec4b1Q7TS58 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clec4b1Q7TS58 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clec4b1Q7TS58 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clec4b1Q7TS58 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms