Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMI3

Uhrf2, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF2, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf2Q7TMI3 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Uhrf2Q7TMI3 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Uhrf2Q7TMI3 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Uhrf2Q7TMI3 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Uhrf2Q7TMI3 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Uhrf2Q7TMI3 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Uhrf2Q7TMI3 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Uhrf2Q7TMI3 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Uhrf2Q7TMI3 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Uhrf2Q7TMI3 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Uhrf2Q7TMI3 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Uhrf2Q7TMI3 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Uhrf2Q7TMI3 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Uhrf2Q7TMI3 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Uhrf2Q7TMI3 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Uhrf2Q7TMI3 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Uhrf2Q7TMI3 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Uhrf2Q7TMI3 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Uhrf2Q7TMI3 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Uhrf2Q7TMI3 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Uhrf2Q7TMI3 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Uhrf2Q7TMI3 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Uhrf2Q7TMI3 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Uhrf2Q7TMI3 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Uhrf2Q7TMI3 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Uhrf2Q7TMI3 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Uhrf2Q7TMI3 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Uhrf2Q7TMI3 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Uhrf2Q7TMI3 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Uhrf2Q7TMI3 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Uhrf2Q7TMI3 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Uhrf2Q7TMI3 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Uhrf2Q7TMI3 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Uhrf2Q7TMI3 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Uhrf2Q7TMI3 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Uhrf2Q7TMI3 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Uhrf2Q7TMI3 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Uhrf2Q7TMI3 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Uhrf2Q7TMI3 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Uhrf2Q7TMI3 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Uhrf2Q7TMI3 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Uhrf2Q7TMI3 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Uhrf2Q7TMI3 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Uhrf2Q7TMI3 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Uhrf2Q7TMI3 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Uhrf2Q7TMI3 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Uhrf2Q7TMI3 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Uhrf2Q7TMI3 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Uhrf2Q7TMI3 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Uhrf2Q7TMI3 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Uhrf2Q7TMI3 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Uhrf2Q7TMI3 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Uhrf2Q7TMI3 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Uhrf2Q7TMI3 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Uhrf2Q7TMI3 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Uhrf2Q7TMI3 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Uhrf2Q7TMI3 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Uhrf2Q7TMI3 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Uhrf2Q7TMI3 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Uhrf2Q7TMI3 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Uhrf2Q7TMI3 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Uhrf2Q7TMI3 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Uhrf2Q7TMI3 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Uhrf2Q7TMI3 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Uhrf2Q7TMI3 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Uhrf2Q7TMI3 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Uhrf2Q7TMI3 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Uhrf2Q7TMI3 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Uhrf2Q7TMI3 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Uhrf2Q7TMI3 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Uhrf2Q7TMI3 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Uhrf2Q7TMI3 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Uhrf2Q7TMI3 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Uhrf2Q7TMI3 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Uhrf2Q7TMI3 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Uhrf2Q7TMI3 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Uhrf2Q7TMI3 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Uhrf2Q7TMI3 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Uhrf2Q7TMI3 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Uhrf2Q7TMI3 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Uhrf2Q7TMI3 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Uhrf2Q7TMI3 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Uhrf2Q7TMI3 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Uhrf2Q7TMI3 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Uhrf2Q7TMI3 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Uhrf2Q7TMI3 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Uhrf2Q7TMI3 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Uhrf2Q7TMI3 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Uhrf2Q7TMI3 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Uhrf2Q7TMI3 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Uhrf2Q7TMI3 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Uhrf2Q7TMI3 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Uhrf2Q7TMI3 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Uhrf2Q7TMI3 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Uhrf2Q7TMI3 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Uhrf2Q7TMI3 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Uhrf2Q7TMI3 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Uhrf2Q7TMI3 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Uhrf2Q7TMI3 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Uhrf2Q7TMI3 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms