Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS4

Cnih3, Protein cornichon homolog 3, mousemouse

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Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih3Q6ZWS4 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnih3Q6ZWS4 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnih3Q6ZWS4 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnih3Q6ZWS4 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnih3Q6ZWS4 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnih3Q6ZWS4 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnih3Q6ZWS4 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnih3Q6ZWS4 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnih3Q6ZWS4 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnih3Q6ZWS4 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnih3Q6ZWS4 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnih3Q6ZWS4 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnih3Q6ZWS4 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnih3Q6ZWS4 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnih3Q6ZWS4 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnih3Q6ZWS4 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnih3Q6ZWS4 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnih3Q6ZWS4 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnih3Q6ZWS4 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cnih3Q6ZWS4 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cnih3Q6ZWS4 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cnih3Q6ZWS4 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cnih3Q6ZWS4 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cnih3Q6ZWS4 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnih3Q6ZWS4 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnih3Q6ZWS4 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnih3Q6ZWS4 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnih3Q6ZWS4 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnih3Q6ZWS4 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnih3Q6ZWS4 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnih3Q6ZWS4 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnih3Q6ZWS4 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnih3Q6ZWS4 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnih3Q6ZWS4 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnih3Q6ZWS4 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnih3Q6ZWS4 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnih3Q6ZWS4 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnih3Q6ZWS4 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnih3Q6ZWS4 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnih3Q6ZWS4 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnih3Q6ZWS4 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnih3Q6ZWS4 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnih3Q6ZWS4 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnih3Q6ZWS4 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnih3Q6ZWS4 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnih3Q6ZWS4 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnih3Q6ZWS4 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnih3Q6ZWS4 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnih3Q6ZWS4 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnih3Q6ZWS4 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnih3Q6ZWS4 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnih3Q6ZWS4 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnih3Q6ZWS4 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnih3Q6ZWS4 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnih3Q6ZWS4 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnih3Q6ZWS4 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnih3Q6ZWS4 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnih3Q6ZWS4 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnih3Q6ZWS4 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnih3Q6ZWS4 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnih3Q6ZWS4 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnih3Q6ZWS4 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnih3Q6ZWS4 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnih3Q6ZWS4 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnih3Q6ZWS4 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnih3Q6ZWS4 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnih3Q6ZWS4 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnih3Q6ZWS4 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnih3Q6ZWS4 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnih3Q6ZWS4 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnih3Q6ZWS4 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnih3Q6ZWS4 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnih3Q6ZWS4 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnih3Q6ZWS4 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnih3Q6ZWS4 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnih3Q6ZWS4 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnih3Q6ZWS4 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnih3Q6ZWS4 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnih3Q6ZWS4 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnih3Q6ZWS4 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnih3Q6ZWS4 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnih3Q6ZWS4 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnih3Q6ZWS4 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnih3Q6ZWS4 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnih3Q6ZWS4 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnih3Q6ZWS4 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnih3Q6ZWS4 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnih3Q6ZWS4 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnih3Q6ZWS4 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnih3Q6ZWS4 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnih3Q6ZWS4 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnih3Q6ZWS4 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnih3Q6ZWS4 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnih3Q6ZWS4 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnih3Q6ZWS4 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnih3Q6ZWS4 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnih3Q6ZWS4 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnih3Q6ZWS4 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnih3Q6ZWS4 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnih3Q6ZWS4 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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