Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPR5

Smpd4, Sphingomyelin phosphodiesterase 4, mousemouse

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd4Q6ZPR5 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smpd4Q6ZPR5 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smpd4Q6ZPR5 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smpd4Q6ZPR5 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smpd4Q6ZPR5 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smpd4Q6ZPR5 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smpd4Q6ZPR5 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smpd4Q6ZPR5 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smpd4Q6ZPR5 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smpd4Q6ZPR5 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smpd4Q6ZPR5 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smpd4Q6ZPR5 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smpd4Q6ZPR5 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smpd4Q6ZPR5 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smpd4Q6ZPR5 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smpd4Q6ZPR5 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Smpd4Q6ZPR5 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smpd4Q6ZPR5 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smpd4Q6ZPR5 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smpd4Q6ZPR5 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smpd4Q6ZPR5 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smpd4Q6ZPR5 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smpd4Q6ZPR5 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smpd4Q6ZPR5 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smpd4Q6ZPR5 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smpd4Q6ZPR5 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smpd4Q6ZPR5 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smpd4Q6ZPR5 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smpd4Q6ZPR5 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smpd4Q6ZPR5 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smpd4Q6ZPR5 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smpd4Q6ZPR5 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smpd4Q6ZPR5 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smpd4Q6ZPR5 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smpd4Q6ZPR5 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smpd4Q6ZPR5 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Smpd4Q6ZPR5 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smpd4Q6ZPR5 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smpd4Q6ZPR5 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smpd4Q6ZPR5 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smpd4Q6ZPR5 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smpd4Q6ZPR5 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smpd4Q6ZPR5 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smpd4Q6ZPR5 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smpd4Q6ZPR5 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smpd4Q6ZPR5 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Smpd4Q6ZPR5 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Smpd4Q6ZPR5 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smpd4Q6ZPR5 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smpd4Q6ZPR5 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Smpd4Q6ZPR5 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smpd4Q6ZPR5 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smpd4Q6ZPR5 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smpd4Q6ZPR5 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smpd4Q6ZPR5 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smpd4Q6ZPR5 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Smpd4Q6ZPR5 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Smpd4Q6ZPR5 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smpd4Q6ZPR5 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smpd4Q6ZPR5 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smpd4Q6ZPR5 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smpd4Q6ZPR5 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smpd4Q6ZPR5 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smpd4Q6ZPR5 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smpd4Q6ZPR5 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smpd4Q6ZPR5 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smpd4Q6ZPR5 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smpd4Q6ZPR5 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Smpd4Q6ZPR5 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smpd4Q6ZPR5 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smpd4Q6ZPR5 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smpd4Q6ZPR5 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smpd4Q6ZPR5 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smpd4Q6ZPR5 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smpd4Q6ZPR5 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smpd4Q6ZPR5 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smpd4Q6ZPR5 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smpd4Q6ZPR5 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smpd4Q6ZPR5 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smpd4Q6ZPR5 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smpd4Q6ZPR5 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smpd4Q6ZPR5 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smpd4Q6ZPR5 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smpd4Q6ZPR5 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smpd4Q6ZPR5 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smpd4Q6ZPR5 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smpd4Q6ZPR5 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smpd4Q6ZPR5 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smpd4Q6ZPR5 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smpd4Q6ZPR5 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smpd4Q6ZPR5 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smpd4Q6ZPR5 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smpd4Q6ZPR5 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smpd4Q6ZPR5 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Smpd4Q6ZPR5 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smpd4Q6ZPR5 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smpd4Q6ZPR5 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Smpd4Q6ZPR5 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smpd4Q6ZPR5 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smpd4Q6ZPR5 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms