Protein–RNA interactions for Protein: Q6VH22

Ift172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift172Q6VH22 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ift172Q6VH22 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ift172Q6VH22 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ift172Q6VH22 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ift172Q6VH22 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ift172Q6VH22 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ift172Q6VH22 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ift172Q6VH22 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ift172Q6VH22 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ift172Q6VH22 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ift172Q6VH22 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ift172Q6VH22 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Ift172Q6VH22 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ift172Q6VH22 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ift172Q6VH22 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ift172Q6VH22 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ift172Q6VH22 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ift172Q6VH22 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ift172Q6VH22 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ift172Q6VH22 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ift172Q6VH22 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ift172Q6VH22 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ift172Q6VH22 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ift172Q6VH22 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ift172Q6VH22 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ift172Q6VH22 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ift172Q6VH22 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ift172Q6VH22 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ift172Q6VH22 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ift172Q6VH22 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ift172Q6VH22 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ift172Q6VH22 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ift172Q6VH22 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ift172Q6VH22 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ift172Q6VH22 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ift172Q6VH22 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ift172Q6VH22 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ift172Q6VH22 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ift172Q6VH22 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Ift172Q6VH22 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ift172Q6VH22 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Ift172Q6VH22 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Ift172Q6VH22 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ift172Q6VH22 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Ift172Q6VH22 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ift172Q6VH22 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Ift172Q6VH22 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ift172Q6VH22 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ift172Q6VH22 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ift172Q6VH22 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ift172Q6VH22 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ift172Q6VH22 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ift172Q6VH22 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ift172Q6VH22 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ift172Q6VH22 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ift172Q6VH22 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ift172Q6VH22 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ift172Q6VH22 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ift172Q6VH22 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ift172Q6VH22 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ift172Q6VH22 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ift172Q6VH22 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ift172Q6VH22 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ift172Q6VH22 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ift172Q6VH22 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ift172Q6VH22 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ift172Q6VH22 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ift172Q6VH22 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Ift172Q6VH22 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ift172Q6VH22 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ift172Q6VH22 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ift172Q6VH22 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ift172Q6VH22 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ift172Q6VH22 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ift172Q6VH22 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ift172Q6VH22 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ift172Q6VH22 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ift172Q6VH22 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ift172Q6VH22 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ift172Q6VH22 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ift172Q6VH22 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ift172Q6VH22 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ift172Q6VH22 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Ift172Q6VH22 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ift172Q6VH22 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ift172Q6VH22 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ift172Q6VH22 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ift172Q6VH22 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ift172Q6VH22 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ift172Q6VH22 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ift172Q6VH22 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ift172Q6VH22 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ift172Q6VH22 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ift172Q6VH22 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Ift172Q6VH22 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ift172Q6VH22 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ift172Q6VH22 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Ift172Q6VH22 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Ift172Q6VH22 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ift172Q6VH22 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms