Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIP5

Nudcd1, NudC domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd1Q6PIP5 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nudcd1Q6PIP5 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nudcd1Q6PIP5 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nudcd1Q6PIP5 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nudcd1Q6PIP5 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nudcd1Q6PIP5 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nudcd1Q6PIP5 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nudcd1Q6PIP5 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nudcd1Q6PIP5 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nudcd1Q6PIP5 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nudcd1Q6PIP5 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nudcd1Q6PIP5 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nudcd1Q6PIP5 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nudcd1Q6PIP5 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nudcd1Q6PIP5 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nudcd1Q6PIP5 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nudcd1Q6PIP5 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nudcd1Q6PIP5 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nudcd1Q6PIP5 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nudcd1Q6PIP5 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nudcd1Q6PIP5 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nudcd1Q6PIP5 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nudcd1Q6PIP5 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nudcd1Q6PIP5 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nudcd1Q6PIP5 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nudcd1Q6PIP5 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nudcd1Q6PIP5 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nudcd1Q6PIP5 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Nudcd1Q6PIP5 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nudcd1Q6PIP5 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nudcd1Q6PIP5 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nudcd1Q6PIP5 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nudcd1Q6PIP5 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nudcd1Q6PIP5 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nudcd1Q6PIP5 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nudcd1Q6PIP5 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nudcd1Q6PIP5 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nudcd1Q6PIP5 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nudcd1Q6PIP5 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nudcd1Q6PIP5 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nudcd1Q6PIP5 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nudcd1Q6PIP5 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nudcd1Q6PIP5 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nudcd1Q6PIP5 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nudcd1Q6PIP5 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nudcd1Q6PIP5 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nudcd1Q6PIP5 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nudcd1Q6PIP5 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nudcd1Q6PIP5 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nudcd1Q6PIP5 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nudcd1Q6PIP5 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nudcd1Q6PIP5 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nudcd1Q6PIP5 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nudcd1Q6PIP5 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nudcd1Q6PIP5 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nudcd1Q6PIP5 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nudcd1Q6PIP5 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nudcd1Q6PIP5 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nudcd1Q6PIP5 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nudcd1Q6PIP5 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nudcd1Q6PIP5 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nudcd1Q6PIP5 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nudcd1Q6PIP5 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Nudcd1Q6PIP5 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nudcd1Q6PIP5 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nudcd1Q6PIP5 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Nudcd1Q6PIP5 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nudcd1Q6PIP5 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nudcd1Q6PIP5 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nudcd1Q6PIP5 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nudcd1Q6PIP5 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nudcd1Q6PIP5 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nudcd1Q6PIP5 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nudcd1Q6PIP5 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nudcd1Q6PIP5 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nudcd1Q6PIP5 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nudcd1Q6PIP5 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nudcd1Q6PIP5 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nudcd1Q6PIP5 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nudcd1Q6PIP5 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Nudcd1Q6PIP5 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nudcd1Q6PIP5 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nudcd1Q6PIP5 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nudcd1Q6PIP5 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nudcd1Q6PIP5 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nudcd1Q6PIP5 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nudcd1Q6PIP5 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nudcd1Q6PIP5 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nudcd1Q6PIP5 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nudcd1Q6PIP5 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nudcd1Q6PIP5 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nudcd1Q6PIP5 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nudcd1Q6PIP5 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nudcd1Q6PIP5 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nudcd1Q6PIP5 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nudcd1Q6PIP5 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nudcd1Q6PIP5 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nudcd1Q6PIP5 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nudcd1Q6PIP5 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nudcd1Q6PIP5 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 261.9 ms