Protein–RNA interactions for Protein: Q6PG16

Hjurp, Holliday junction recognition protein, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HjurpQ6PG16 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HjurpQ6PG16 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
HjurpQ6PG16 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HjurpQ6PG16 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HjurpQ6PG16 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
HjurpQ6PG16 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HjurpQ6PG16 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HjurpQ6PG16 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HjurpQ6PG16 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HjurpQ6PG16 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HjurpQ6PG16 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HjurpQ6PG16 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HjurpQ6PG16 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HjurpQ6PG16 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HjurpQ6PG16 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HjurpQ6PG16 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HjurpQ6PG16 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HjurpQ6PG16 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HjurpQ6PG16 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HjurpQ6PG16 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HjurpQ6PG16 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HjurpQ6PG16 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HjurpQ6PG16 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HjurpQ6PG16 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HjurpQ6PG16 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HjurpQ6PG16 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HjurpQ6PG16 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HjurpQ6PG16 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HjurpQ6PG16 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HjurpQ6PG16 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HjurpQ6PG16 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HjurpQ6PG16 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HjurpQ6PG16 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HjurpQ6PG16 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HjurpQ6PG16 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HjurpQ6PG16 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HjurpQ6PG16 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HjurpQ6PG16 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HjurpQ6PG16 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HjurpQ6PG16 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HjurpQ6PG16 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HjurpQ6PG16 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HjurpQ6PG16 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HjurpQ6PG16 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HjurpQ6PG16 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HjurpQ6PG16 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HjurpQ6PG16 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HjurpQ6PG16 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
HjurpQ6PG16 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HjurpQ6PG16 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HjurpQ6PG16 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HjurpQ6PG16 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HjurpQ6PG16 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HjurpQ6PG16 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HjurpQ6PG16 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
HjurpQ6PG16 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HjurpQ6PG16 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HjurpQ6PG16 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HjurpQ6PG16 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HjurpQ6PG16 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HjurpQ6PG16 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HjurpQ6PG16 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HjurpQ6PG16 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HjurpQ6PG16 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
HjurpQ6PG16 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
HjurpQ6PG16 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HjurpQ6PG16 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HjurpQ6PG16 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HjurpQ6PG16 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HjurpQ6PG16 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HjurpQ6PG16 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HjurpQ6PG16 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
HjurpQ6PG16 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HjurpQ6PG16 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HjurpQ6PG16 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HjurpQ6PG16 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HjurpQ6PG16 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HjurpQ6PG16 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HjurpQ6PG16 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HjurpQ6PG16 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HjurpQ6PG16 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HjurpQ6PG16 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
HjurpQ6PG16 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
HjurpQ6PG16 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
HjurpQ6PG16 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HjurpQ6PG16 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HjurpQ6PG16 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HjurpQ6PG16 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HjurpQ6PG16 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HjurpQ6PG16 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HjurpQ6PG16 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
HjurpQ6PG16 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HjurpQ6PG16 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HjurpQ6PG16 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HjurpQ6PG16 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HjurpQ6PG16 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HjurpQ6PG16 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HjurpQ6PG16 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HjurpQ6PG16 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HjurpQ6PG16 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms