Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFX8

Rimkla, N-acetylaspartylglutamate synthase A, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RimklaQ6PFX8 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RimklaQ6PFX8 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RimklaQ6PFX8 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RimklaQ6PFX8 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RimklaQ6PFX8 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RimklaQ6PFX8 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RimklaQ6PFX8 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RimklaQ6PFX8 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RimklaQ6PFX8 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RimklaQ6PFX8 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RimklaQ6PFX8 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RimklaQ6PFX8 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RimklaQ6PFX8 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RimklaQ6PFX8 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RimklaQ6PFX8 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RimklaQ6PFX8 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RimklaQ6PFX8 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RimklaQ6PFX8 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RimklaQ6PFX8 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RimklaQ6PFX8 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RimklaQ6PFX8 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RimklaQ6PFX8 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RimklaQ6PFX8 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RimklaQ6PFX8 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RimklaQ6PFX8 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RimklaQ6PFX8 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RimklaQ6PFX8 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RimklaQ6PFX8 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RimklaQ6PFX8 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RimklaQ6PFX8 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RimklaQ6PFX8 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RimklaQ6PFX8 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RimklaQ6PFX8 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RimklaQ6PFX8 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RimklaQ6PFX8 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RimklaQ6PFX8 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RimklaQ6PFX8 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RimklaQ6PFX8 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RimklaQ6PFX8 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RimklaQ6PFX8 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RimklaQ6PFX8 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RimklaQ6PFX8 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RimklaQ6PFX8 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RimklaQ6PFX8 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RimklaQ6PFX8 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RimklaQ6PFX8 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RimklaQ6PFX8 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RimklaQ6PFX8 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RimklaQ6PFX8 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RimklaQ6PFX8 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RimklaQ6PFX8 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RimklaQ6PFX8 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RimklaQ6PFX8 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RimklaQ6PFX8 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RimklaQ6PFX8 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RimklaQ6PFX8 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RimklaQ6PFX8 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RimklaQ6PFX8 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RimklaQ6PFX8 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RimklaQ6PFX8 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RimklaQ6PFX8 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RimklaQ6PFX8 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RimklaQ6PFX8 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RimklaQ6PFX8 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RimklaQ6PFX8 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RimklaQ6PFX8 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RimklaQ6PFX8 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RimklaQ6PFX8 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RimklaQ6PFX8 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RimklaQ6PFX8 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RimklaQ6PFX8 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RimklaQ6PFX8 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RimklaQ6PFX8 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RimklaQ6PFX8 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RimklaQ6PFX8 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RimklaQ6PFX8 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RimklaQ6PFX8 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RimklaQ6PFX8 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RimklaQ6PFX8 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RimklaQ6PFX8 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RimklaQ6PFX8 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RimklaQ6PFX8 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RimklaQ6PFX8 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RimklaQ6PFX8 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RimklaQ6PFX8 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RimklaQ6PFX8 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RimklaQ6PFX8 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RimklaQ6PFX8 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RimklaQ6PFX8 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RimklaQ6PFX8 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RimklaQ6PFX8 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RimklaQ6PFX8 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RimklaQ6PFX8 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RimklaQ6PFX8 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RimklaQ6PFX8 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RimklaQ6PFX8 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RimklaQ6PFX8 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RimklaQ6PFX8 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RimklaQ6PFX8 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RimklaQ6PFX8 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms