Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDZ2

Taf1c, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1cQ6PDZ2 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Taf1cQ6PDZ2 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Taf1cQ6PDZ2 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Taf1cQ6PDZ2 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Taf1cQ6PDZ2 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Taf1cQ6PDZ2 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Taf1cQ6PDZ2 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Taf1cQ6PDZ2 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Taf1cQ6PDZ2 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Taf1cQ6PDZ2 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Taf1cQ6PDZ2 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Taf1cQ6PDZ2 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Taf1cQ6PDZ2 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Taf1cQ6PDZ2 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Taf1cQ6PDZ2 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Taf1cQ6PDZ2 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Taf1cQ6PDZ2 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Taf1cQ6PDZ2 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Taf1cQ6PDZ2 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Taf1cQ6PDZ2 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Taf1cQ6PDZ2 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Taf1cQ6PDZ2 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Taf1cQ6PDZ2 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Taf1cQ6PDZ2 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Taf1cQ6PDZ2 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Taf1cQ6PDZ2 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Taf1cQ6PDZ2 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Taf1cQ6PDZ2 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Taf1cQ6PDZ2 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Taf1cQ6PDZ2 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Taf1cQ6PDZ2 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Taf1cQ6PDZ2 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Taf1cQ6PDZ2 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Taf1cQ6PDZ2 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Taf1cQ6PDZ2 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Taf1cQ6PDZ2 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Taf1cQ6PDZ2 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Taf1cQ6PDZ2 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Taf1cQ6PDZ2 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Taf1cQ6PDZ2 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Taf1cQ6PDZ2 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Taf1cQ6PDZ2 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Taf1cQ6PDZ2 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Taf1cQ6PDZ2 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Taf1cQ6PDZ2 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Taf1cQ6PDZ2 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Taf1cQ6PDZ2 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Taf1cQ6PDZ2 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Taf1cQ6PDZ2 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Taf1cQ6PDZ2 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Taf1cQ6PDZ2 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Taf1cQ6PDZ2 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Taf1cQ6PDZ2 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Taf1cQ6PDZ2 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Taf1cQ6PDZ2 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Taf1cQ6PDZ2 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Taf1cQ6PDZ2 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Taf1cQ6PDZ2 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Taf1cQ6PDZ2 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Taf1cQ6PDZ2 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Taf1cQ6PDZ2 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Taf1cQ6PDZ2 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Taf1cQ6PDZ2 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Taf1cQ6PDZ2 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Taf1cQ6PDZ2 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Taf1cQ6PDZ2 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Taf1cQ6PDZ2 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Taf1cQ6PDZ2 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Taf1cQ6PDZ2 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Taf1cQ6PDZ2 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Taf1cQ6PDZ2 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Taf1cQ6PDZ2 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Taf1cQ6PDZ2 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Taf1cQ6PDZ2 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Taf1cQ6PDZ2 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Taf1cQ6PDZ2 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Taf1cQ6PDZ2 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Taf1cQ6PDZ2 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Taf1cQ6PDZ2 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Taf1cQ6PDZ2 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Taf1cQ6PDZ2 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Taf1cQ6PDZ2 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Taf1cQ6PDZ2 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Taf1cQ6PDZ2 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Taf1cQ6PDZ2 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Taf1cQ6PDZ2 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Taf1cQ6PDZ2 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Taf1cQ6PDZ2 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Taf1cQ6PDZ2 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Taf1cQ6PDZ2 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Taf1cQ6PDZ2 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Taf1cQ6PDZ2 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Taf1cQ6PDZ2 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Taf1cQ6PDZ2 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Taf1cQ6PDZ2 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Taf1cQ6PDZ2 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Taf1cQ6PDZ2 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Taf1cQ6PDZ2 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Taf1cQ6PDZ2 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Taf1cQ6PDZ2 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms