Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB75

Papd7, Non-canonical poly(A) RNA polymerase PAPD7, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Papd7Q6PB75 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Papd7Q6PB75 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Papd7Q6PB75 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Papd7Q6PB75 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Papd7Q6PB75 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Papd7Q6PB75 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Papd7Q6PB75 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Papd7Q6PB75 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Papd7Q6PB75 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Papd7Q6PB75 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Papd7Q6PB75 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Papd7Q6PB75 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Papd7Q6PB75 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Papd7Q6PB75 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Papd7Q6PB75 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Papd7Q6PB75 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Papd7Q6PB75 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Papd7Q6PB75 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Papd7Q6PB75 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Papd7Q6PB75 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Papd7Q6PB75 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Papd7Q6PB75 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Papd7Q6PB75 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Papd7Q6PB75 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Papd7Q6PB75 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Papd7Q6PB75 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Papd7Q6PB75 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Papd7Q6PB75 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Papd7Q6PB75 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Papd7Q6PB75 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Papd7Q6PB75 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Papd7Q6PB75 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Papd7Q6PB75 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Papd7Q6PB75 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Papd7Q6PB75 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Papd7Q6PB75 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Papd7Q6PB75 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Papd7Q6PB75 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Papd7Q6PB75 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Papd7Q6PB75 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Papd7Q6PB75 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Papd7Q6PB75 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Papd7Q6PB75 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Papd7Q6PB75 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Papd7Q6PB75 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Papd7Q6PB75 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Papd7Q6PB75 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Papd7Q6PB75 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Papd7Q6PB75 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Papd7Q6PB75 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Papd7Q6PB75 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Papd7Q6PB75 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Papd7Q6PB75 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Papd7Q6PB75 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Papd7Q6PB75 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Papd7Q6PB75 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Papd7Q6PB75 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Papd7Q6PB75 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Papd7Q6PB75 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Papd7Q6PB75 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Papd7Q6PB75 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Papd7Q6PB75 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Papd7Q6PB75 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Papd7Q6PB75 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Papd7Q6PB75 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Papd7Q6PB75 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Papd7Q6PB75 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Papd7Q6PB75 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Papd7Q6PB75 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Papd7Q6PB75 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Papd7Q6PB75 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Papd7Q6PB75 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Papd7Q6PB75 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Papd7Q6PB75 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Papd7Q6PB75 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Papd7Q6PB75 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Papd7Q6PB75 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Papd7Q6PB75 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Papd7Q6PB75 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Papd7Q6PB75 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Papd7Q6PB75 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Papd7Q6PB75 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Papd7Q6PB75 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Papd7Q6PB75 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Papd7Q6PB75 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Papd7Q6PB75 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Papd7Q6PB75 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Papd7Q6PB75 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Papd7Q6PB75 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Papd7Q6PB75 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Papd7Q6PB75 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Papd7Q6PB75 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Papd7Q6PB75 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Papd7Q6PB75 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Papd7Q6PB75 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Papd7Q6PB75 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Papd7Q6PB75 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Papd7Q6PB75 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Papd7Q6PB75 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Papd7Q6PB75 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms