Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4T0

Atg2a, Autophagy-related protein 2 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 1,914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2aQ6P4T0 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg2aQ6P4T0 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg2aQ6P4T0 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg2aQ6P4T0 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg2aQ6P4T0 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg2aQ6P4T0 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg2aQ6P4T0 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg2aQ6P4T0 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg2aQ6P4T0 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atg2aQ6P4T0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atg2aQ6P4T0 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atg2aQ6P4T0 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atg2aQ6P4T0 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atg2aQ6P4T0 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atg2aQ6P4T0 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atg2aQ6P4T0 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atg2aQ6P4T0 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atg2aQ6P4T0 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atg2aQ6P4T0 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atg2aQ6P4T0 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atg2aQ6P4T0 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atg2aQ6P4T0 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atg2aQ6P4T0 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atg2aQ6P4T0 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atg2aQ6P4T0 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atg2aQ6P4T0 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atg2aQ6P4T0 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atg2aQ6P4T0 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atg2aQ6P4T0 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atg2aQ6P4T0 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atg2aQ6P4T0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atg2aQ6P4T0 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Atg2aQ6P4T0 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atg2aQ6P4T0 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atg2aQ6P4T0 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atg2aQ6P4T0 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atg2aQ6P4T0 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atg2aQ6P4T0 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atg2aQ6P4T0 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atg2aQ6P4T0 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atg2aQ6P4T0 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atg2aQ6P4T0 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atg2aQ6P4T0 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atg2aQ6P4T0 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atg2aQ6P4T0 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atg2aQ6P4T0 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atg2aQ6P4T0 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atg2aQ6P4T0 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atg2aQ6P4T0 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atg2aQ6P4T0 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atg2aQ6P4T0 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atg2aQ6P4T0 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Atg2aQ6P4T0 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atg2aQ6P4T0 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atg2aQ6P4T0 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atg2aQ6P4T0 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atg2aQ6P4T0 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atg2aQ6P4T0 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Atg2aQ6P4T0 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atg2aQ6P4T0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atg2aQ6P4T0 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atg2aQ6P4T0 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atg2aQ6P4T0 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atg2aQ6P4T0 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atg2aQ6P4T0 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atg2aQ6P4T0 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atg2aQ6P4T0 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atg2aQ6P4T0 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atg2aQ6P4T0 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atg2aQ6P4T0 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atg2aQ6P4T0 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atg2aQ6P4T0 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Atg2aQ6P4T0 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atg2aQ6P4T0 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atg2aQ6P4T0 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atg2aQ6P4T0 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atg2aQ6P4T0 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atg2aQ6P4T0 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atg2aQ6P4T0 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Atg2aQ6P4T0 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atg2aQ6P4T0 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atg2aQ6P4T0 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atg2aQ6P4T0 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atg2aQ6P4T0 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atg2aQ6P4T0 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atg2aQ6P4T0 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atg2aQ6P4T0 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atg2aQ6P4T0 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Atg2aQ6P4T0 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Atg2aQ6P4T0 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Atg2aQ6P4T0 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Atg2aQ6P4T0 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Atg2aQ6P4T0 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atg2aQ6P4T0 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atg2aQ6P4T0 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atg2aQ6P4T0 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atg2aQ6P4T0 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atg2aQ6P4T0 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atg2aQ6P4T0 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atg2aQ6P4T0 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms