Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZP2

Gpbp1l1, Vasculin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1l1Q6NZP2 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gpbp1l1Q6NZP2 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gpbp1l1Q6NZP2 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gpbp1l1Q6NZP2 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gpbp1l1Q6NZP2 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gpbp1l1Q6NZP2 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gpbp1l1Q6NZP2 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gpbp1l1Q6NZP2 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gpbp1l1Q6NZP2 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gpbp1l1Q6NZP2 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gpbp1l1Q6NZP2 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gpbp1l1Q6NZP2 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gpbp1l1Q6NZP2 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gpbp1l1Q6NZP2 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gpbp1l1Q6NZP2 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gpbp1l1Q6NZP2 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gpbp1l1Q6NZP2 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Gpbp1l1Q6NZP2 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gpbp1l1Q6NZP2 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gpbp1l1Q6NZP2 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gpbp1l1Q6NZP2 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gpbp1l1Q6NZP2 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gpbp1l1Q6NZP2 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gpbp1l1Q6NZP2 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Gpbp1l1Q6NZP2 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gpbp1l1Q6NZP2 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gpbp1l1Q6NZP2 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gpbp1l1Q6NZP2 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gpbp1l1Q6NZP2 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gpbp1l1Q6NZP2 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gpbp1l1Q6NZP2 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gpbp1l1Q6NZP2 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gpbp1l1Q6NZP2 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gpbp1l1Q6NZP2 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Gpbp1l1Q6NZP2 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gpbp1l1Q6NZP2 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gpbp1l1Q6NZP2 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Gpbp1l1Q6NZP2 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gpbp1l1Q6NZP2 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Gpbp1l1Q6NZP2 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Gpbp1l1Q6NZP2 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gpbp1l1Q6NZP2 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gpbp1l1Q6NZP2 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gpbp1l1Q6NZP2 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gpbp1l1Q6NZP2 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gpbp1l1Q6NZP2 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gpbp1l1Q6NZP2 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gpbp1l1Q6NZP2 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gpbp1l1Q6NZP2 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gpbp1l1Q6NZP2 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gpbp1l1Q6NZP2 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gpbp1l1Q6NZP2 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gpbp1l1Q6NZP2 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gpbp1l1Q6NZP2 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gpbp1l1Q6NZP2 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gpbp1l1Q6NZP2 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gpbp1l1Q6NZP2 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gpbp1l1Q6NZP2 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gpbp1l1Q6NZP2 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gpbp1l1Q6NZP2 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Gpbp1l1Q6NZP2 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Gpbp1l1Q6NZP2 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gpbp1l1Q6NZP2 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Gpbp1l1Q6NZP2 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gpbp1l1Q6NZP2 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gpbp1l1Q6NZP2 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gpbp1l1Q6NZP2 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gpbp1l1Q6NZP2 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gpbp1l1Q6NZP2 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gpbp1l1Q6NZP2 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gpbp1l1Q6NZP2 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gpbp1l1Q6NZP2 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gpbp1l1Q6NZP2 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gpbp1l1Q6NZP2 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gpbp1l1Q6NZP2 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gpbp1l1Q6NZP2 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gpbp1l1Q6NZP2 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gpbp1l1Q6NZP2 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gpbp1l1Q6NZP2 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gpbp1l1Q6NZP2 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Gpbp1l1Q6NZP2 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms