Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXW6

Rad17, Cell cycle checkpoint protein RAD17, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad17Q6NXW6 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Rad17Q6NXW6 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rad17Q6NXW6 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rad17Q6NXW6 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rad17Q6NXW6 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rad17Q6NXW6 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rad17Q6NXW6 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rad17Q6NXW6 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rad17Q6NXW6 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Rad17Q6NXW6 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Rad17Q6NXW6 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rad17Q6NXW6 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rad17Q6NXW6 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rad17Q6NXW6 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rad17Q6NXW6 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rad17Q6NXW6 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rad17Q6NXW6 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Rad17Q6NXW6 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rad17Q6NXW6 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rad17Q6NXW6 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rad17Q6NXW6 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rad17Q6NXW6 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rad17Q6NXW6 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rad17Q6NXW6 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rad17Q6NXW6 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rad17Q6NXW6 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Rad17Q6NXW6 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rad17Q6NXW6 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rad17Q6NXW6 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rad17Q6NXW6 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rad17Q6NXW6 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rad17Q6NXW6 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rad17Q6NXW6 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rad17Q6NXW6 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Rad17Q6NXW6 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rad17Q6NXW6 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rad17Q6NXW6 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rad17Q6NXW6 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rad17Q6NXW6 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rad17Q6NXW6 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rad17Q6NXW6 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Rad17Q6NXW6 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rad17Q6NXW6 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rad17Q6NXW6 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rad17Q6NXW6 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rad17Q6NXW6 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rad17Q6NXW6 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Rad17Q6NXW6 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rad17Q6NXW6 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rad17Q6NXW6 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rad17Q6NXW6 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rad17Q6NXW6 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rad17Q6NXW6 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rad17Q6NXW6 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rad17Q6NXW6 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rad17Q6NXW6 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rad17Q6NXW6 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rad17Q6NXW6 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rad17Q6NXW6 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rad17Q6NXW6 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rad17Q6NXW6 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rad17Q6NXW6 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rad17Q6NXW6 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rad17Q6NXW6 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rad17Q6NXW6 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rad17Q6NXW6 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rad17Q6NXW6 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rad17Q6NXW6 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rad17Q6NXW6 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rad17Q6NXW6 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rad17Q6NXW6 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rad17Q6NXW6 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rad17Q6NXW6 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Rad17Q6NXW6 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rad17Q6NXW6 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rad17Q6NXW6 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rad17Q6NXW6 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rad17Q6NXW6 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rad17Q6NXW6 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rad17Q6NXW6 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rad17Q6NXW6 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rad17Q6NXW6 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rad17Q6NXW6 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rad17Q6NXW6 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rad17Q6NXW6 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rad17Q6NXW6 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rad17Q6NXW6 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rad17Q6NXW6 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rad17Q6NXW6 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rad17Q6NXW6 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rad17Q6NXW6 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rad17Q6NXW6 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rad17Q6NXW6 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rad17Q6NXW6 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rad17Q6NXW6 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rad17Q6NXW6 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rad17Q6NXW6 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rad17Q6NXW6 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Rad17Q6NXW6 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Rad17Q6NXW6 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms