Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXN1

Szrd1, SUZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Szrd1Q6NXN1 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Szrd1Q6NXN1 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Szrd1Q6NXN1 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Szrd1Q6NXN1 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Szrd1Q6NXN1 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Szrd1Q6NXN1 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Szrd1Q6NXN1 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Szrd1Q6NXN1 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Szrd1Q6NXN1 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Szrd1Q6NXN1 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Szrd1Q6NXN1 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Szrd1Q6NXN1 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Szrd1Q6NXN1 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Szrd1Q6NXN1 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Szrd1Q6NXN1 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Szrd1Q6NXN1 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Szrd1Q6NXN1 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Szrd1Q6NXN1 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Szrd1Q6NXN1 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Szrd1Q6NXN1 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Szrd1Q6NXN1 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Szrd1Q6NXN1 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Szrd1Q6NXN1 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Szrd1Q6NXN1 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Szrd1Q6NXN1 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Szrd1Q6NXN1 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Szrd1Q6NXN1 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Szrd1Q6NXN1 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Szrd1Q6NXN1 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Szrd1Q6NXN1 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Szrd1Q6NXN1 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Szrd1Q6NXN1 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Szrd1Q6NXN1 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Szrd1Q6NXN1 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Szrd1Q6NXN1 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Szrd1Q6NXN1 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Szrd1Q6NXN1 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Szrd1Q6NXN1 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Szrd1Q6NXN1 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Szrd1Q6NXN1 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Szrd1Q6NXN1 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Szrd1Q6NXN1 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Szrd1Q6NXN1 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Szrd1Q6NXN1 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Szrd1Q6NXN1 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Szrd1Q6NXN1 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Szrd1Q6NXN1 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Szrd1Q6NXN1 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Szrd1Q6NXN1 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Szrd1Q6NXN1 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Szrd1Q6NXN1 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Szrd1Q6NXN1 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Szrd1Q6NXN1 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Szrd1Q6NXN1 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
Szrd1Q6NXN1 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Szrd1Q6NXN1 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Szrd1Q6NXN1 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Szrd1Q6NXN1 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Szrd1Q6NXN1 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Szrd1Q6NXN1 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Szrd1Q6NXN1 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Szrd1Q6NXN1 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Szrd1Q6NXN1 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Szrd1Q6NXN1 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Szrd1Q6NXN1 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Szrd1Q6NXN1 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Szrd1Q6NXN1 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Szrd1Q6NXN1 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Szrd1Q6NXN1 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Szrd1Q6NXN1 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Szrd1Q6NXN1 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Szrd1Q6NXN1 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Szrd1Q6NXN1 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Szrd1Q6NXN1 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Szrd1Q6NXN1 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Szrd1Q6NXN1 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Szrd1Q6NXN1 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Szrd1Q6NXN1 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Szrd1Q6NXN1 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Szrd1Q6NXN1 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Szrd1Q6NXN1 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Szrd1Q6NXN1 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Szrd1Q6NXN1 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Szrd1Q6NXN1 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Szrd1Q6NXN1 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Szrd1Q6NXN1 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Szrd1Q6NXN1 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Szrd1Q6NXN1 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Szrd1Q6NXN1 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Szrd1Q6NXN1 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Szrd1Q6NXN1 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Szrd1Q6NXN1 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Szrd1Q6NXN1 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Szrd1Q6NXN1 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Szrd1Q6NXN1 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Szrd1Q6NXN1 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Szrd1Q6NXN1 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Szrd1Q6NXN1 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Szrd1Q6NXN1 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Szrd1Q6NXN1 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms