Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXI6

Rprd2, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd2Q6NXI6 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rprd2Q6NXI6 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rprd2Q6NXI6 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rprd2Q6NXI6 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rprd2Q6NXI6 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rprd2Q6NXI6 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rprd2Q6NXI6 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Rprd2Q6NXI6 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rprd2Q6NXI6 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rprd2Q6NXI6 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rprd2Q6NXI6 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rprd2Q6NXI6 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rprd2Q6NXI6 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rprd2Q6NXI6 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rprd2Q6NXI6 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rprd2Q6NXI6 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rprd2Q6NXI6 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rprd2Q6NXI6 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rprd2Q6NXI6 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rprd2Q6NXI6 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rprd2Q6NXI6 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Rprd2Q6NXI6 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rprd2Q6NXI6 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rprd2Q6NXI6 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rprd2Q6NXI6 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rprd2Q6NXI6 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Rprd2Q6NXI6 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Rprd2Q6NXI6 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Rprd2Q6NXI6 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rprd2Q6NXI6 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rprd2Q6NXI6 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Rprd2Q6NXI6 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rprd2Q6NXI6 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rprd2Q6NXI6 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rprd2Q6NXI6 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rprd2Q6NXI6 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rprd2Q6NXI6 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rprd2Q6NXI6 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rprd2Q6NXI6 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rprd2Q6NXI6 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rprd2Q6NXI6 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Rprd2Q6NXI6 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Rprd2Q6NXI6 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rprd2Q6NXI6 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rprd2Q6NXI6 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rprd2Q6NXI6 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rprd2Q6NXI6 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rprd2Q6NXI6 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rprd2Q6NXI6 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rprd2Q6NXI6 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rprd2Q6NXI6 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rprd2Q6NXI6 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rprd2Q6NXI6 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rprd2Q6NXI6 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rprd2Q6NXI6 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rprd2Q6NXI6 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rprd2Q6NXI6 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rprd2Q6NXI6 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rprd2Q6NXI6 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rprd2Q6NXI6 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rprd2Q6NXI6 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Rprd2Q6NXI6 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rprd2Q6NXI6 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rprd2Q6NXI6 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Rprd2Q6NXI6 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rprd2Q6NXI6 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rprd2Q6NXI6 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rprd2Q6NXI6 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rprd2Q6NXI6 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rprd2Q6NXI6 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rprd2Q6NXI6 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rprd2Q6NXI6 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rprd2Q6NXI6 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rprd2Q6NXI6 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rprd2Q6NXI6 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rprd2Q6NXI6 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rprd2Q6NXI6 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rprd2Q6NXI6 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rprd2Q6NXI6 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rprd2Q6NXI6 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rprd2Q6NXI6 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rprd2Q6NXI6 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rprd2Q6NXI6 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rprd2Q6NXI6 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rprd2Q6NXI6 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rprd2Q6NXI6 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rprd2Q6NXI6 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rprd2Q6NXI6 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rprd2Q6NXI6 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rprd2Q6NXI6 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Rprd2Q6NXI6 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rprd2Q6NXI6 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rprd2Q6NXI6 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rprd2Q6NXI6 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rprd2Q6NXI6 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rprd2Q6NXI6 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Rprd2Q6NXI6 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rprd2Q6NXI6 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rprd2Q6NXI6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rprd2Q6NXI6 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.7 ms