Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS46

Pdcd11, Protein RRP5 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd11Q6NS46 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pdcd11Q6NS46 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Pdcd11Q6NS46 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pdcd11Q6NS46 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pdcd11Q6NS46 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pdcd11Q6NS46 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pdcd11Q6NS46 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Pdcd11Q6NS46 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pdcd11Q6NS46 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pdcd11Q6NS46 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pdcd11Q6NS46 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pdcd11Q6NS46 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pdcd11Q6NS46 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pdcd11Q6NS46 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pdcd11Q6NS46 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pdcd11Q6NS46 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pdcd11Q6NS46 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pdcd11Q6NS46 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pdcd11Q6NS46 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Pdcd11Q6NS46 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pdcd11Q6NS46 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pdcd11Q6NS46 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Pdcd11Q6NS46 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pdcd11Q6NS46 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pdcd11Q6NS46 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pdcd11Q6NS46 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Pdcd11Q6NS46 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pdcd11Q6NS46 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Pdcd11Q6NS46 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pdcd11Q6NS46 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pdcd11Q6NS46 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pdcd11Q6NS46 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pdcd11Q6NS46 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pdcd11Q6NS46 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Pdcd11Q6NS46 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Pdcd11Q6NS46 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pdcd11Q6NS46 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pdcd11Q6NS46 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Pdcd11Q6NS46 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pdcd11Q6NS46 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pdcd11Q6NS46 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pdcd11Q6NS46 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pdcd11Q6NS46 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pdcd11Q6NS46 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pdcd11Q6NS46 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pdcd11Q6NS46 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pdcd11Q6NS46 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pdcd11Q6NS46 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pdcd11Q6NS46 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pdcd11Q6NS46 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pdcd11Q6NS46 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pdcd11Q6NS46 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pdcd11Q6NS46 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Pdcd11Q6NS46 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pdcd11Q6NS46 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pdcd11Q6NS46 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pdcd11Q6NS46 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pdcd11Q6NS46 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pdcd11Q6NS46 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pdcd11Q6NS46 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pdcd11Q6NS46 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pdcd11Q6NS46 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pdcd11Q6NS46 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pdcd11Q6NS46 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pdcd11Q6NS46 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Pdcd11Q6NS46 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pdcd11Q6NS46 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pdcd11Q6NS46 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pdcd11Q6NS46 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pdcd11Q6NS46 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pdcd11Q6NS46 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pdcd11Q6NS46 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pdcd11Q6NS46 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pdcd11Q6NS46 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pdcd11Q6NS46 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pdcd11Q6NS46 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pdcd11Q6NS46 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pdcd11Q6NS46 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pdcd11Q6NS46 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Pdcd11Q6NS46 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Pdcd11Q6NS46 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Pdcd11Q6NS46 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Pdcd11Q6NS46 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Pdcd11Q6NS46 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Pdcd11Q6NS46 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Pdcd11Q6NS46 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Pdcd11Q6NS46 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pdcd11Q6NS46 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pdcd11Q6NS46 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pdcd11Q6NS46 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pdcd11Q6NS46 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pdcd11Q6NS46 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Pdcd11Q6NS46 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pdcd11Q6NS46 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Pdcd11Q6NS46 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pdcd11Q6NS46 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pdcd11Q6NS46 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pdcd11Q6NS46 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Pdcd11Q6NS46 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pdcd11Q6NS46 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms